84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1627 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
207 aa  414  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  57.41 
 
 
307 aa  68.2  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  37.78 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  42.35 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  38.67 
 
 
205 aa  61.6  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1998  peptidoglycan-binding LysM  47.46 
 
 
123 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0170304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  48.94 
 
 
335 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  41.54 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0689  Peptidoglycan-binding LysM  43.28 
 
 
186 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.82 
 
 
327 aa  55.1  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
500 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  53.57 
 
 
175 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.81 
 
 
391 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1073  Peptidoglycan-binding LysM  52.27 
 
 
221 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  39.66 
 
 
590 aa  51.6  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  46.55 
 
 
530 aa  52  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  34.57 
 
 
432 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4545  spore coat assembly protein SafA  47.92 
 
 
604 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4172  spoVID-dependent spore coat assembly factor; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein  47.83 
 
 
621 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4324  lysM domain-containing protein  47.83 
 
 
587 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  51.11 
 
 
709 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  41.82 
 
 
341 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4161  spoVID-dependent spore coat assembly factor SafA; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein PspC  47.83 
 
 
609 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4507  spore coat assembly protein SafA  47.83 
 
 
615 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219196 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4559  spovid-dependent spore coat assembly factor safa; ftsk/spoiiie family protein; surface protein pspc  47.83 
 
 
613 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  32.89 
 
 
266 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  42 
 
 
179 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0648  peptidoglycan-binding LysM  48 
 
 
1225 aa  48.5  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323072  normal  0.0929491 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  43.75 
 
 
520 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0704  peptidoglycan-binding LysM  36.67 
 
 
411 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4659  lysm domain-containing protein  51.28 
 
 
582 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00627115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0920  spore coat assembly protein SafA  41.3 
 
 
538 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0690  SpoVID-dependent spore coat assembly factor SafA  47.92 
 
 
631 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.538953  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2242  Peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 
334 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4512  lysM domain-containing protein  51.28 
 
 
608 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  46.81 
 
 
465 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1285  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.11 
 
 
376 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  50.94 
 
 
173 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  41.18 
 
 
274 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2836  peptidoglycan-binding LysM  35.59 
 
 
583 aa  45.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00147111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.73 
 
 
470 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  46.81 
 
 
374 aa  45.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  43.75 
 
 
520 aa  45.1  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  38 
 
 
423 aa  45.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 
374 aa  45.1  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1622  putative cell wall lytic enzyme  45.45 
 
 
136 aa  44.7  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 
376 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 
374 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1839  aggregation promoting factor-like surface protein  43.18 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 
374 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 
376 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 
376 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 
376 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235775 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  44.68 
 
 
378 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  36.36 
 
 
261 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 
112 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0200  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.67 
 
 
175 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.502395  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0797  peptidoglycan-binding LysM  40.62 
 
 
579 aa  43.9  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  36.73 
 
 
522 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  47.83 
 
 
674 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  40.48 
 
 
338 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  36.84 
 
 
394 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  44 
 
 
420 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_46  putative cell wall degradation protein  40 
 
 
739 aa  42.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  37.5 
 
 
419 aa  42.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  40 
 
 
426 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0031  putative cell wall degradation enzyme  41.67 
 
 
739 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2065  Peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 
278 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  33.02 
 
 
341 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4273  spore coat assembly protein SafA  43.48 
 
 
721 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  44 
 
 
503 aa  42.4  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2121  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.13 
 
 
259 aa  42.4  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  30.93 
 
 
279 aa  42  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  30.93 
 
 
279 aa  42  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  22.28 
 
 
314 aa  42  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.07 
 
 
433 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  30.3 
 
 
277 aa  42  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2827  Peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 
130 aa  41.6  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797997  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1855  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.83 
 
 
208 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.653374  normal  0.622298 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  41.3 
 
 
197 aa  41.6  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  47.62 
 
 
274 aa  41.2  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  30.23 
 
 
353 aa  41.2  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0050  Peptidoglycan-binding LysM  38.3 
 
 
507 aa  41.2  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>