26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1613 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1613  SurA domain  100 
 
 
255 aa  481  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000247502  unclonable  3.15321e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2045  SurA domain  35.61 
 
 
232 aa  91.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000747352  decreased coverage  0.0000000000259869 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22470  SurA-like protein  28.67 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0157  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.8 
 
 
317 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194598  hitchhiker  0.00636853 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0287  SurA domain protein  24.74 
 
 
320 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0568  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.25 
 
 
353 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000504659  normal  0.286887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21140  peptidil-prolyl cis-trans isomerase  26.09 
 
 
332 aa  52.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0594  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.62 
 
 
301 aa  52  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2908  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.27 
 
 
341 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000327787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12160  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.15 
 
 
495 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000838067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1416  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.78 
 
 
352 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.146032  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3888  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.13 
 
 
336 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0659  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.09 
 
 
324 aa  49.7  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1078  hypothetical protein  24.86 
 
 
340 aa  49.3  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0989  SurA domain protein  28.31 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.47061  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1262  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.82 
 
 
343 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  27.33 
 
 
311 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0553768 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.64 
 
 
316 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2806  peptidylprolyl isomerase  20.7 
 
 
342 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1716  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.92 
 
 
380 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0112  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.39 
 
 
344 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000942479  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0089  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  29.41 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.322667  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4490  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.69 
 
 
338 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4471  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.69 
 
 
336 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2492  peptidylprolyl isomerase  21.46 
 
 
342 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2338  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.85 
 
 
436 aa  42  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.571441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>