20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1610 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1610  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  873    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640568  unclonable  5.93437e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0433  hypothetical protein  61.15 
 
 
426 aa  554  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1253  hypothetical protein  26.54 
 
 
444 aa  155  9e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.325224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1112  hypothetical protein  26.46 
 
 
433 aa  136  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1720  hypothetical protein  25.87 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26756  normal  0.377885 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3838  hypothetical protein  26.03 
 
 
428 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1362  hypothetical protein  25.94 
 
 
438 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0907  hypothetical protein  24.73 
 
 
433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.68427  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1497  hypothetical protein  25 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1941  hypothetical protein  25.41 
 
 
428 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08450  hypothetical protein  22.75 
 
 
422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2914  hypothetical protein  24.07 
 
 
432 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1717  hypothetical protein  20.62 
 
 
468 aa  90.1  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000202258 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1771  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  24.41 
 
 
740 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212253  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0089  hypothetical protein  25.17 
 
 
431 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.678836  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2914  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.7 
 
 
1070 aa  50.8  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6302  hypothetical protein  27.32 
 
 
401 aa  50.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344575  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  22.18 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.03 
 
 
420 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1541  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.81 
 
 
1077 aa  43.9  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>