188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1600 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1600  hydrolase of metallo-beta-lactamase fold  100 
 
 
281 aa  570  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.949503  unclonable  2.1744e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  33.85 
 
 
454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  30.82 
 
 
294 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  34.02 
 
 
502 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  31.37 
 
 
461 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  30.68 
 
 
284 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  29.15 
 
 
461 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  29.15 
 
 
461 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  30.11 
 
 
348 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  29.15 
 
 
461 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  29.15 
 
 
461 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
421 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 
352 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  31.35 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 
406 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  29.07 
 
 
336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  28.51 
 
 
257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 
451 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  26.91 
 
 
390 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 
320 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2283  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  29.41 
 
 
342 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  29.2 
 
 
283 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
451 aa  105  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  26.67 
 
 
292 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 
281 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4102  beta-lactamase domain protein  25.59 
 
 
386 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.08 
 
 
780 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  26.83 
 
 
291 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.68 
 
 
840 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.77 
 
 
818 aa  99.8  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  28.75 
 
 
295 aa  99.4  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.04 
 
 
759 aa  99  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.2 
 
 
778 aa  99  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 
453 aa  98.6  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  26.94 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.01 
 
 
773 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  25.51 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2727  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 
374 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  27.38 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  27.38 
 
 
300 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.85 
 
 
749 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.34 
 
 
797 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.85 
 
 
814 aa  96.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.21 
 
 
794 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  27.38 
 
 
300 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  26.61 
 
 
443 aa  95.9  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  26.12 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  26.94 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  26.94 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  26.94 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  28.09 
 
 
746 aa  94.4  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  22.99 
 
 
300 aa  93.2  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 
300 aa  93.2  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.27 
 
 
791 aa  92.8  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  26.74 
 
 
286 aa  92.8  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.46 
 
 
773 aa  92.4  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.46 
 
 
654 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.24 
 
 
773 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  26.34 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  28.35 
 
 
773 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.48 
 
 
773 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.46 
 
 
772 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.46 
 
 
772 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.2 
 
 
773 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1867  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 
477 aa  88.6  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0121854 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.57 
 
 
682 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  24.7 
 
 
367 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.2 
 
 
773 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.7 
 
 
750 aa  86.3  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.73 
 
 
796 aa  86.3  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.46 
 
 
761 aa  85.9  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.71 
 
 
679 aa  85.5  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.01 
 
 
745 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1942  beta-lactamase-like  25.51 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1174  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  25.2 
 
 
761 aa  84.7  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000121236  hitchhiker  0.000000673843 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.45 
 
 
757 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.57 
 
 
798 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  29.07 
 
 
795 aa  82.4  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.84 
 
 
795 aa  82.4  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3143  copper amine oxidase domain-containing protein  30.33 
 
 
455 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.700617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.65 
 
 
789 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.49 
 
 
775 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1588  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  25.28 
 
 
760 aa  78.2  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  24.29 
 
 
479 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.74 
 
 
709 aa  76.3  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000127283  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  23.84 
 
 
363 aa  75.5  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.71 
 
 
868 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.95 
 
 
771 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.58 
 
 
811 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2129  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.11 
 
 
829 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326593  normal  0.0900672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  25.99 
 
 
872 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5966  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.53 
 
 
829 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2111  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.53 
 
 
829 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.261797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.86 
 
 
808 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.67 
 
 
752 aa  70.1  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  26.67 
 
 
738 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2389  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.14 
 
 
831 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00142105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.18 
 
 
786 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.75 
 
 
777 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>