More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1587 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1587  cold-shock DNA-binding protein family  100 
 
 		 66 aa  132  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000012511  unclonable  7.72165e-24 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  74.24 
 
 		 77 aa  104  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.73 
 
 		 66 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  72.73 
 
 		 66 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  74.24 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2223  cold-shock DNA-binding protein family  75 
 
 		 65 aa  102  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000339527  decreased coverage  1.60158e-22 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  72.73 
 
 		 66 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  72.73 
 
 		 66 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  73.85 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  73.85 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  73.85 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  73.85 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.73 
 
 		 66 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  73.85 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  73.85 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  73.85 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  73.85 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1327  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 65 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00843058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  70.77 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 		 83 aa  98.2  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1720  cold shock protein CspB  70.31 
 
 		 65 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  70.77 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1474  cold shock protein  70.31 
 
 		 65 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  70.31 
 
 		 65 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  70.31 
 
 		 65 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  70.31 
 
 		 65 aa  97.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  70.31 
 
 		 65 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  69.23 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  69.23 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  69.23 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  69.23 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  69.23 
 
 		 65 aa  97.1  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.44 
 
 		 65 aa  96.7  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  69.23 
 
 		 65 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  69.23 
 
 		 65 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1584  cold-shock DNA-binding protein family  73.13 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297873  unclonable  9.08249e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  68.75 
 
 		 65 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1817  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  68.75 
 
 		 65 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1697  cold shock protein CspB  68.75 
 
 		 65 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  70.77 
 
 		 66 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.69 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16470  putative cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.463030000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 		 65 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 65 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 		 65 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.19 
 
 		 65 aa  94.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05490  putative cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 		 68 aa  94.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.94484e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 66 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  71.43 
 
 		 65 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.6 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 65 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1232  cold shock protein CspA  68.25 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000325579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2454  cold shock protein CspA  71.43 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  70.77 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2257  cold shock protein CspA  71.43 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000681816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  70.77 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2216  cold shock protein  71.43 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.62754e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  70.77 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2177  cold shock protein  71.43 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  70.77 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  70.77 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2422  cold shock protein CspA  71.43 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  70.77 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  70.77 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2440  cold shock protein CspA  71.43 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11145 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  70.77 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  70.77 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2521  cold shock protein CspA  71.43 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000175758  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  65.15 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  65.15 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1054  cold shock protein CspA  66.67 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920965  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1029  cold shock protein  66.67 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00447e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1135  cold shock protein CspA  66.67 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2178  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 		 65 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1505  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.248091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 66 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1376  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.69 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128629  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.15 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4154  cold shock protein CspA  65.08 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1032  cold shock protein  65.08 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000608124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1035  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000461706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1289  cold shock protein CspA  65.08 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1185  cold shock protein CspA  65.08 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0756  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.69 
 
 		 66 aa  90.9  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000688666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1213  cold shock protein CspA  66.67 
 
 		 67 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05400  putative cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 67 aa  90.5  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.33246e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.32 
 
 		 66 aa  90.1  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2370  cold shock proteins  62.12 
 
 		 66 aa  90.1  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.71289e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2387  cold shock protein CspA  69.84 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343372  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.62 
 
 		 65 aa  89.4  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0392  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.61 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2944  cold shock protein CspA  69.84 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000190383  hitchhiker  0.00000000328218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>