More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1573 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 
328 aa  679    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  53.27 
 
 
332 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  51.4 
 
 
329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 
332 aa  336  3.9999999999999995e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 
330 aa  334  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 
337 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  49.53 
 
 
332 aa  333  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 
330 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 
330 aa  332  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 
330 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 
330 aa  332  5e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 
330 aa  332  5e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  51.23 
 
 
326 aa  332  5e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  52.35 
 
 
328 aa  332  7.000000000000001e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 
337 aa  331  8e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 
330 aa  331  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  51.67 
 
 
328 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  50.47 
 
 
333 aa  330  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 
330 aa  329  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  51.38 
 
 
329 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  49.06 
 
 
329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  51.83 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  50.76 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 
327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 
324 aa  326  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 
323 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  49.69 
 
 
331 aa  325  6e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 
328 aa  324  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 
329 aa  323  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 
324 aa  322  4e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 
328 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  47.72 
 
 
333 aa  321  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  50.94 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  49.69 
 
 
354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  47.71 
 
 
330 aa  318  7.999999999999999e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  47.71 
 
 
330 aa  318  7.999999999999999e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
326 aa  318  1e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  49.08 
 
 
330 aa  317  2e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  43.87 
 
 
327 aa  315  5e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  48.92 
 
 
326 aa  314  9.999999999999999e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  48.16 
 
 
334 aa  314  9.999999999999999e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 
324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  50.61 
 
 
332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  47.4 
 
 
330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  46.63 
 
 
330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 
332 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  47.55 
 
 
330 aa  311  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 
332 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  46.32 
 
 
328 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  47.55 
 
 
330 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 
325 aa  310  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  47.04 
 
 
332 aa  310  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  46.71 
 
 
327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  48.17 
 
 
333 aa  306  3e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  48.37 
 
 
348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  47.11 
 
 
331 aa  305  5.0000000000000004e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  47.83 
 
 
328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  48.57 
 
 
328 aa  301  7.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  46.34 
 
 
328 aa  301  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 
331 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  47.48 
 
 
332 aa  299  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  46.08 
 
 
331 aa  299  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 
329 aa  297  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  46.79 
 
 
331 aa  296  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  45.79 
 
 
328 aa  294  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  45 
 
 
322 aa  293  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  46.86 
 
 
337 aa  293  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  46.37 
 
 
318 aa  293  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  45.6 
 
 
328 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  46.03 
 
 
328 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  46.06 
 
 
319 aa  292  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  46.08 
 
 
329 aa  291  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  45.94 
 
 
338 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  43.9 
 
 
327 aa  290  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  44.24 
 
 
332 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  41.57 
 
 
334 aa  290  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  45.08 
 
 
327 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  46.08 
 
 
329 aa  288  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  43.61 
 
 
332 aa  288  8e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  44.44 
 
 
327 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  43.71 
 
 
324 aa  288  9e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  43.44 
 
 
356 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  46.63 
 
 
328 aa  287  2e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  42.55 
 
 
320 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  44.2 
 
 
330 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  46.23 
 
 
337 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  42.95 
 
 
328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  44.92 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  45.31 
 
 
330 aa  285  7e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  44.03 
 
 
327 aa  285  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  44.83 
 
 
321 aa  285  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  41.72 
 
 
334 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  45.28 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  44.34 
 
 
326 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  44.65 
 
 
327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  42.63 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  44.03 
 
 
324 aa  282  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1618  UDP-galactose 4-epimerase  43.71 
 
 
350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  43.96 
 
 
326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  43.57 
 
 
327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>