87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1542 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  100 
 
 
344 aa  650    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  35.23 
 
 
474 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  30.61 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  27.46 
 
 
486 aa  115  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  34.12 
 
 
1085 aa  106  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  29.18 
 
 
620 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  30 
 
 
522 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.09 
 
 
1655 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  28.48 
 
 
498 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_003296  RS01777  GALA protein  30.77 
 
 
981 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1357  GALA protein 5  29.89 
 
 
647 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146674  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  43.51 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1007  hypothetical protein  28.83 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0458  leucine-rich repeat-containing ribonuclease inhibitor  24.24 
 
 
516 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363451  normal  0.370511 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  29.68 
 
 
760 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  25.09 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  29.58 
 
 
542 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  26.81 
 
 
661 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  28.83 
 
 
766 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0620  hypothetical protein  37.59 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  30.53 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  28.47 
 
 
755 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  25 
 
 
995 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  28.27 
 
 
760 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  27.86 
 
 
1351 aa  63.9  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  26.05 
 
 
1088 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  27.92 
 
 
766 aa  63.5  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  31.74 
 
 
197 aa  63.2  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  25.2 
 
 
1012 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  25.48 
 
 
858 aa  62.8  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  27.03 
 
 
531 aa  62.8  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  41.05 
 
 
507 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  24.8 
 
 
954 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  25.41 
 
 
765 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  25.41 
 
 
779 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  24.07 
 
 
1112 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  29.69 
 
 
399 aa  60.8  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  24.07 
 
 
1070 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  24.07 
 
 
1070 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  25.24 
 
 
643 aa  60.1  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  33.16 
 
 
467 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  30.47 
 
 
421 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  25.08 
 
 
772 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.12 
 
 
1107 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  24.39 
 
 
993 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  26.03 
 
 
692 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  23.98 
 
 
994 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  26.37 
 
 
718 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6624  hypothetical protein  33.65 
 
 
175 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  41.89 
 
 
468 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02003  GALA protein  24.74 
 
 
518 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128117  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0729  hypothetical protein  26.84 
 
 
476 aa  55.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2175  hypothetical protein  36.54 
 
 
437 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.48 
 
 
481 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0489  hypothetical protein  37.04 
 
 
452 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  32 
 
 
503 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40174  predicted protein  24.66 
 
 
897 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1565  hypothetical protein  59.46 
 
 
121 aa  52.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000901713 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  21.67 
 
 
1052 aa  52.8  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  32.12 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  24.8 
 
 
1011 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  23.02 
 
 
614 aa  51.2  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1814  hypothetical protein  25.86 
 
 
304 aa  50.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2988  hypothetical protein  35.44 
 
 
456 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874903  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  28.67 
 
 
471 aa  50.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1852  hypothetical protein  27.64 
 
 
553 aa  49.7  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  31.82 
 
 
729 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1379  predicted protein  30.59 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.815814  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  22.68 
 
 
781 aa  48.9  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1857  hypothetical protein  27.64 
 
 
553 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  27.12 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2293  predicted protein  26.46 
 
 
432 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  24.31 
 
 
466 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  27.89 
 
 
724 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4339  predicted protein  24.89 
 
 
222 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00625498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  35 
 
 
2142 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  23.23 
 
 
772 aa  46.2  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  24.08 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  24.08 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  25.1 
 
 
692 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0025  cyclin domain-containing protein  28.57 
 
 
807 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  30.73 
 
 
400 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16663  predicted protein  25.4 
 
 
1048 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.207195 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2319  hypothetical protein  33.66 
 
 
442 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.722749  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1754  LRR-repeat protein  34.58 
 
 
167 aa  42.7  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.022386 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  27.17 
 
 
789 aa  42.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  27.17 
 
 
789 aa  42.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>