More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1310 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  100 
 
 
239 aa  478  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  77.46 
 
 
249 aa  341  5.999999999999999e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  74.88 
 
 
241 aa  335  5e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  68.49 
 
 
241 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  72.88 
 
 
239 aa  332  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  76.15 
 
 
239 aa  331  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  71.79 
 
 
241 aa  331  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  71.97 
 
 
239 aa  331  8e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  71.97 
 
 
239 aa  331  8e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  71.97 
 
 
239 aa  331  8e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  71.97 
 
 
239 aa  331  8e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  71.97 
 
 
239 aa  331  8e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  71.97 
 
 
239 aa  331  8e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  71.97 
 
 
239 aa  331  8e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  71.97 
 
 
239 aa  331  8e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  71.97 
 
 
239 aa  331  8e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  73.28 
 
 
239 aa  330  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  71.55 
 
 
243 aa  329  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  74.77 
 
 
239 aa  328  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  75.23 
 
 
243 aa  328  4e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  75.46 
 
 
244 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  68.35 
 
 
242 aa  311  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  71.03 
 
 
235 aa  310  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  71.03 
 
 
235 aa  310  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  70.87 
 
 
249 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  64.73 
 
 
240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  70.42 
 
 
241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  64.68 
 
 
246 aa  293  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  67.28 
 
 
245 aa  293  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  60.25 
 
 
244 aa  281  8.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  49.03 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  50 
 
 
231 aa  208  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  49.52 
 
 
234 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  50.46 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  48.8 
 
 
236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  47.64 
 
 
233 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  45.45 
 
 
232 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  47.17 
 
 
233 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  47.69 
 
 
226 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  49.05 
 
 
236 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  48.02 
 
 
265 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  48.51 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  48.02 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  48.02 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  48.02 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  48.02 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  48.02 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  48.02 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  48.02 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  46.97 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  48.02 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  43.24 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  43.41 
 
 
244 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  46.45 
 
 
232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  45.12 
 
 
219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  48.96 
 
 
207 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  55.08 
 
 
149 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  35.25 
 
 
259 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  34.1 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  33.33 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  34.87 
 
 
256 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  33.33 
 
 
255 aa  118  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1067  sporulation sigma factor SigG  33.59 
 
 
257 aa  118  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000166979  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  59.38 
 
 
114 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  33.85 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  33.85 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  35.27 
 
 
257 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  33.2 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  34.41 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  33.99 
 
 
260 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  34.21 
 
 
257 aa  111  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4053  sporulation sigma factor SigG  32.83 
 
 
257 aa  111  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000132793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  30.97 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3948  sporulation sigma factor SigG  30.6 
 
 
289 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000196829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3754  sporulation sigma factor SigG  30.6 
 
 
289 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000419985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3645  sporulation sigma factor SigG  30.6 
 
 
289 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74076e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3662  sporulation sigma factor SigG  30.6 
 
 
289 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000167357  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  31.03 
 
 
259 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  31.42 
 
 
259 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  33.21 
 
 
257 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  33.33 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  46.43 
 
 
118 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4042  sporulation sigma factor SigG  31.03 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000307551  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  31.42 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1311  sporulation sigma factor SigG  32.66 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000268367  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4004  sporulation sigma factor SigG  31.03 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3917  sporulation sigma factor SigG  31.03 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000372162 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3955  sporulation sigma factor SigG  31.03 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000614575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  31.03 
 
 
259 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  55.1 
 
 
118 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0064  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  32.41 
 
 
285 aa  105  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.534501  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1203  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  34.41 
 
 
281 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3442  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  32.26 
 
 
261 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  46.74 
 
 
126 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1744  sporulation sigma factor SigF  30.57 
 
 
256 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3983  sporulation sigma factor SigF  30.61 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00304797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4205  sporulation sigma factor SigF  30.61 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4294  sporulation sigma factor SigF  30.61 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.728684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4182  sporulation sigma factor SigF  30.61 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0460854  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1056  sporulation sigma factor SigF  30.61 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.656155  normal  0.0661655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>