More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1288 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1691  GTP pyrophosphokinase  47.6 
 
 		 729 aa  702    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.599497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4526  GTP diphosphokinase  50.82 
 
 		 727 aa  786    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1459  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.62 
 
 		 743 aa  693    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0005  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.65 
 
 		 728 aa  645    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0005  GTP pyrophosphokinase  44.79 
 
 		 728 aa  649    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2236  GTP pyrophosphokinase  50.21 
 
 		 716 aa  737    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12190  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  51.71 
 
 		 716 aa  778    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000855141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1400  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.26 
 
 		 746 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1196  GTP pyrophosphokinase  47.19 
 
 		 729 aa  663    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0487271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4491  GTP pyrophosphokinase  50.68 
 
 		 727 aa  786    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02111  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase, (ppGpp)ase  46.54 
 
 		 769 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3187  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.48 
 
 		 714 aa  699    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0520  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.09 
 
 		 781 aa  657    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0839645  hitchhiker  0.0000697847 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1951  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  52.05 
 
 		 726 aa  779    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1052  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.37 
 
 		 716 aa  735    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000106243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1288  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  100 
 
 		 729 aa  1511    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0314087  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4302  GTP pyrophosphokinase  50.82 
 
 		 727 aa  785    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4140  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  50.68 
 
 		 727 aa  785    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4151  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  51.09 
 
 		 727 aa  793    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0901  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  52.71 
 
 		 712 aa  781    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0988529  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3042  (p)ppGpp synthetase I  45.73 
 
 		 758 aa  654    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21900  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  43.77 
 
 		 789 aa  673    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3123  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  50.89 
 
 		 727 aa  788    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00942759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1311  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.34 
 
 		 738 aa  654    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1299  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.26 
 
 		 746 aa  647    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0721  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.11 
 
 		 745 aa  666    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000459955  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2090  RelA/SpoT protein  43.85 
 
 		 814 aa  647    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2058  (p)ppGpp synthetase I  43.71 
 
 		 786 aa  643    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.226647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4122  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.19 
 
 		 774 aa  655    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0947  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.48 
 
 		 721 aa  645    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.452547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4989  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  48.25 
 
 		 751 aa  678    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2359  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.78 
 
 		 793 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4487  GTP diphosphokinase  50.68 
 
 		 727 aa  784    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000280159 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0971  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.77 
 
 		 727 aa  716    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000148672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2287  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  51.73 
 
 		 727 aa  772    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421652  hitchhiker  0.000000120051 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0885  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.2 
 
 		 733 aa  679    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02091  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase, (ppGpp)ase  46.69 
 
 		 769 aa  649    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2325  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  50.28 
 
 		 716 aa  731    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000013827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1433  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.62 
 
 		 743 aa  693    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4637  GTP pyrophosphokinase  50.82 
 
 		 727 aa  785    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0193  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase, (ppGpp)ase  47 
 
 		 769 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1377  metal dependent phosphohydrolase  47.76 
 
 		 779 aa  689    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.790837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1536  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.7 
 
 		 719 aa  638    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0733  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  51.8 
 
 		 721 aa  784    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000178164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1680  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  54.57 
 
 		 717 aa  844    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0127021 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2550  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  44.54 
 
 		 746 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1213  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.2 
 
 		 756 aa  653    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.167676  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0998  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.64 
 
 		 721 aa  649    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0910  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.99 
 
 		 726 aa  660    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.746196  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3171  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.67 
 
 		 861 aa  651    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100702  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2319  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.11 
 
 		 806 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.528198  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0175  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  43.79 
 
 		 740 aa  657    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0548  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.05 
 
 		 813 aa  720    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2280  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.11 
 
 		 801 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.753689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.78 
 
 		 742 aa  698    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_5  relA/spoT protein, GTP pyrophosphokinase  44.93 
 
 		 728 aa  654    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1951  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  55.68 
 
 		 726 aa  831    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000567155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2193  GTP pyrophosphokinase  50.07 
 
 		 726 aa  749    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1904  GTP pyrophosphokinase  49.37 
 
 		 726 aa  739    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2097  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  53.03 
 
 		 725 aa  823    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1724  GTP pyrophosphokinase  47.6 
 
 		 729 aa  702    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2653  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.6 
 
 		 750 aa  681    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1219  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.4 
 
 		 771 aa  660    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0709  GTP diphosphokinase  50.82 
 
 		 727 aa  786    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.348241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4541  GTP diphosphokinase  50.68 
 
 		 727 aa  784    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0431  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.24 
 
 		 715 aa  651    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3160  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.44 
 
 		 716 aa  730    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000534468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4254  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  51.23 
 
 		 727 aa  792    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00950275  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02201  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase, (ppGpp)ase  46.3 
 
 		 769 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0806  GTP diphosphokinase  52.14 
 
 		 734 aa  783    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000171798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3609  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  52.22 
 
 		 726 aa  783    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00130344  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1363  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.11 
 
 		 804 aa  638    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.401853  normal  0.596174 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0092  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  44.84 
 
 		 740 aa  652    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0587  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  43.91 
 
 		 748 aa  662    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00257021  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0857  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  45.66 
 
 		 750 aa  692    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1367  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  43.54 
 
 		 731 aa  652    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.709372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0379  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  52.14 
 
 		 710 aa  786    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04010  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  43.71 
 
 		 856 aa  664    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.710721 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0939  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  53.28 
 
 		 732 aa  819    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2057  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.5 
 
 		 716 aa  642    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000250061  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2720  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.5 
 
 		 802 aa  659    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.865135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.15 
 
 		 820 aa  637    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.865833  normal  0.439631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2399  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.23 
 
 		 717 aa  720    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.088294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1344  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  52.14 
 
 		 724 aa  777    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000566061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2116  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.58 
 
 		 807 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0339196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2510  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  53.69 
 
 		 732 aa  817    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00123268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2284  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.3 
 
 		 716 aa  728    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0529541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2327  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.11 
 
 		 801 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0335883  normal  0.296201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4829  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.41 
 
 		 749 aa  673    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3211  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.51 
 
 		 716 aa  736    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00108978  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2572  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.1 
 
 		 748 aa  646    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3812  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.05 
 
 		 790 aa  632  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1673  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.05 
 
 		 781 aa  634  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1569  metal dependent phosphohydrolase  43.3 
 
 		 715 aa  634  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4475  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.69 
 
 		 751 aa  633  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12603  GTP pyrophosphokinase relA  42.11 
 
 		 790 aa  632  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000342988  normal  0.752099 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15130  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  42.49 
 
 		 812 aa  632  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0120895  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2587  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.91 
 
 		 788 aa  632  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3380  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.31 
 
 		 822 aa  630  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000200325  hitchhiker  0.00033219 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1146  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.29 
 
 		 717 aa  631  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144176  normal  0.638752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>