More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1214 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  100 
 
 
626 aa  1291    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  43.92 
 
 
599 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  36.89 
 
 
604 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  39.31 
 
 
599 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  42.06 
 
 
601 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  38.13 
 
 
600 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  36.09 
 
 
571 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  35.08 
 
 
598 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  37.19 
 
 
611 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  35.08 
 
 
598 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.56 
 
 
598 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  41.79 
 
 
614 aa  369  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  35.08 
 
 
598 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  35.08 
 
 
598 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  35.08 
 
 
598 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  35.08 
 
 
598 aa  365  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.3 
 
 
605 aa  363  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  34.89 
 
 
600 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  34.78 
 
 
598 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  34.78 
 
 
598 aa  361  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  36.41 
 
 
599 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  39.95 
 
 
601 aa  357  3.9999999999999996e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  42.11 
 
 
598 aa  352  8e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  32.95 
 
 
583 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.45 
 
 
595 aa  345  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  40 
 
 
604 aa  342  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  35.19 
 
 
595 aa  342  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  32.45 
 
 
582 aa  340  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  33.44 
 
 
587 aa  337  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  34.34 
 
 
595 aa  337  5e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  32.35 
 
 
588 aa  336  9e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  39.86 
 
 
619 aa  332  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  35.3 
 
 
578 aa  328  1.0000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  34.4 
 
 
613 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  32.01 
 
 
587 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  32.99 
 
 
593 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  33.98 
 
 
652 aa  322  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  37.62 
 
 
682 aa  319  1e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  36.22 
 
 
655 aa  317  5e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  37.04 
 
 
686 aa  317  6e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  35.71 
 
 
651 aa  314  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  31.06 
 
 
598 aa  312  1e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  33.9 
 
 
590 aa  311  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  35.45 
 
 
684 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  30.66 
 
 
636 aa  311  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  33.9 
 
 
590 aa  310  4e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  33.92 
 
 
584 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  31.02 
 
 
629 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  36.76 
 
 
605 aa  306  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  32.94 
 
 
588 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  34.03 
 
 
623 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  36.23 
 
 
613 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  34.2 
 
 
662 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  35.88 
 
 
703 aa  303  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  37.73 
 
 
604 aa  303  8.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  32.17 
 
 
605 aa  303  9e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  32.17 
 
 
605 aa  303  9e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  37.61 
 
 
632 aa  301  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  33.78 
 
 
606 aa  300  4e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  38.6 
 
 
633 aa  300  5e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  31.55 
 
 
617 aa  300  7e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  31.04 
 
 
673 aa  298  1e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1502  DNA primase  32.98 
 
 
583 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00809258  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  36.94 
 
 
636 aa  298  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  30.74 
 
 
621 aa  297  3e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  39.22 
 
 
577 aa  297  4e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  30.36 
 
 
623 aa  296  6e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  36.9 
 
 
653 aa  296  7e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  35.39 
 
 
674 aa  296  9e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  32.97 
 
 
617 aa  296  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  34.62 
 
 
694 aa  296  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  28.75 
 
 
651 aa  295  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  35.73 
 
 
656 aa  294  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  35.53 
 
 
660 aa  293  7e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  38.94 
 
 
564 aa  292  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  37.85 
 
 
579 aa  292  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  31.82 
 
 
614 aa  291  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  33.58 
 
 
651 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  32.32 
 
 
588 aa  292  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  35.29 
 
 
676 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  30.26 
 
 
601 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  37.79 
 
 
632 aa  291  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  28.37 
 
 
642 aa  290  4e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  29.41 
 
 
658 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  34.39 
 
 
652 aa  290  8e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  34.92 
 
 
656 aa  289  9e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  37.64 
 
 
655 aa  289  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  34.36 
 
 
660 aa  289  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  35.33 
 
 
679 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  29.15 
 
 
644 aa  288  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  35.92 
 
 
640 aa  288  2e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  38.43 
 
 
631 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  31.9 
 
 
588 aa  287  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  38.6 
 
 
587 aa  287  5e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  40.37 
 
 
675 aa  286  8e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  31.97 
 
 
675 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  36.81 
 
 
582 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  37.85 
 
 
660 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  36.68 
 
 
598 aa  284  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.21 
 
 
663 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>