224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1206 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  100 
 
 
257 aa  529  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  37.27 
 
 
273 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  30.5 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  29.96 
 
 
244 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  29.22 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  30.98 
 
 
258 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  27.69 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  29.1 
 
 
248 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  28.64 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  28.69 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  27.46 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  27.46 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  27.46 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  27.46 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  27.46 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  32.07 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  27.46 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  27.87 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  27.87 
 
 
248 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  26.46 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  26.59 
 
 
267 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  33.91 
 
 
251 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  28.81 
 
 
250 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  26.64 
 
 
248 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  27.91 
 
 
253 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  32.77 
 
 
283 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  27.8 
 
 
262 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  28.78 
 
 
253 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  26.64 
 
 
249 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  24.89 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  28.23 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  28.07 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  26.48 
 
 
248 aa  96.3  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  30.22 
 
 
263 aa  93.2  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  29.19 
 
 
260 aa  92  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  32.16 
 
 
246 aa  89.4  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  28.79 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  31.49 
 
 
243 aa  85.9  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  25.2 
 
 
244 aa  85.9  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  30.46 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  26.7 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 
258 aa  82  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  29.86 
 
 
217 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  29.41 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  28.99 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  29.52 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  27.02 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  31.11 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  29.25 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 
243 aa  79  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  29.14 
 
 
243 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  28.42 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  26.02 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  29.08 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  28.76 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  28.73 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0995  DNA repair protein RecO  30.72 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1732  DNA repair protein RecO  33.54 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.467987  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0930  DNA repair protein RecO  30.72 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133285  normal  0.103629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  25.68 
 
 
256 aa  72  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  23.03 
 
 
250 aa  72  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  27.07 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0843  DNA repair protein RecO  31.93 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  27.87 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  28.33 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  25 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  28.33 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2464  DNA repair protein RecO  32.53 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2817  DNA repair protein RecO  32.53 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2777  DNA repair protein RecO  32.53 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2838  DNA repair protein RecO  32.53 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  28.33 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1787  DNA repair protein RecO  32.53 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806002  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0545  DNA repair protein RecO  32.53 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2893  DNA repair protein RecO  32.53 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  28.32 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  27.81 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  28.22 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  28.32 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  28.32 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  24.39 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  26.88 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  26.49 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  24.47 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  24.17 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2271  DNA repair protein RecO  31.01 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1986  DNA repair protein RecO  31.01 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2897  DNA repair protein RecO  31.93 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.64605  normal  0.158668 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0990  DNA replication and repair protein RecO  21.72 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000715553  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  22.46 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  29.12 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  27.27 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  23.98 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  26.82 
 
 
273 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  29.57 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  21.72 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  26.82 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1087  DNA repair protein RecO  31.52 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  26.97 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000558246  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  26.26 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>