More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1172 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1172  RNase HI  100 
 
 		 152 aa  317  5e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000482938  hitchhiker  0.000107341 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  61.7 
 
 		 159 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  63.43 
 
 		 152 aa  193  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  63.04 
 
 		 155 aa  192  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  62.24 
 
 		 146 aa  188  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  61.81 
 
 		 147 aa  187  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1744  ribonuclease H  61.38 
 
 		 146 aa  187  5.999999999999999e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  57.64 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1754  ribonuclease H  60.42 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  58.87 
 
 		 146 aa  181  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  58.62 
 
 		 146 aa  181  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  54.61 
 
 		 146 aa  170  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  56.83 
 
 		 145 aa  170  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  59.29 
 
 		 145 aa  169  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  55.71 
 
 		 153 aa  169  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  55.32 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  57.55 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  49.65 
 
 		 154 aa  156  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  49.32 
 
 		 159 aa  156  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  53.57 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  53.57 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  54.23 
 
 		 155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  51.77 
 
 		 150 aa  149  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  52.14 
 
 		 162 aa  150  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0304  ribonuclease H  51.05 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0206259  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  51.75 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  51.43 
 
 		 145 aa  147  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  50.36 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  50 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  49.31 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  52.17 
 
 		 157 aa  147  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  51.43 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  51.43 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  49.64 
 
 		 241 aa  147  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1258  ribonuclease H  55.15 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  51.39 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  49.32 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  53.62 
 
 		 154 aa  146  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  51.82 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4434  Ribonuclease H  47.55 
 
 		 163 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  50 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4372  Ribonuclease H  47.55 
 
 		 163 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  52.9 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0317  Ribonuclease H  52.21 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  52.14 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  50 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  53.19 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  52.17 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  51.08 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  48.61 
 
 		 148 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  48.61 
 
 		 148 aa  143  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  50.71 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  50.71 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1662  Ribonuclease H  52.52 
 
 		 185 aa  142  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  49.29 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  50.36 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  49.65 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0852  ribonuclease H  50.68 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0905  ribonuclease H  46.94 
 
 		 175 aa  141  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.690877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  51.45 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  50 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  47.97 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  49.3 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1619  ribonuclease H  49.28 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353009  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  50 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  50.75 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1704  ribonuclease H  50 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229425  normal  0.715434 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  48.94 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  47.59 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  51.11 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0409  ribonuclease H  50 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  47.83 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  48.98 
 
 		 170 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  47.83 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  47.83 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  48.89 
 
 		 146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  48.57 
 
 		 145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  46.48 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  48.91 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  48.55 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0761  ribonuclease H  49.64 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  47.83 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0263  ribonuclease H  48.2 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.988009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  48.2 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  48.95 
 
 		 143 aa  137  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  49.28 
 
 		 148 aa  137  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  49.64 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  47.89 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  47.83 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  47.83 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  47.83 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  47.48 
 
 		 163 aa  136  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  48.95 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1763  ribonuclease H  46.85 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  47.83 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0424  ribonuclease H  46.85 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  47.83 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  47.83 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  42.55 
 
 		 236 aa  136  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1479  RNase HI  48.55 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00461786  normal  0.20485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>