22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1171 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1171  putative component of D-ornithine aminomutase  100 
 
 
456 aa  929    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333128  decreased coverage  0.0000285962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1482  hypothetical protein  49.55 
 
 
447 aa  422  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000544917  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21090  DNA mismatch repair protein MutL  48.79 
 
 
447 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1665  methylaspartate mutase  48.74 
 
 
468 aa  410  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1816  methylaspartate mutase  45.15 
 
 
450 aa  402  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0316  hypothetical protein  45.05 
 
 
455 aa  380  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2691  glutamate mutase, MutL  37.66 
 
 
462 aa  269  7e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1024  hypothetical protein  35.5 
 
 
459 aa  258  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000932144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15450  conserved hypothetical protein TIGR01319  37.9 
 
 
464 aa  256  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000232195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1346  glutamate mutase, MutL  31.88 
 
 
461 aa  229  7e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4402  glutamate mutase, MutL  35.41 
 
 
460 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3947  glutamate mutase large subunit, B12-dependent  32.12 
 
 
454 aa  196  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2155  glutamate mutase, MutL  35.5 
 
 
471 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.932369 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0831  putative glutamate mutase mutL  36.8 
 
 
462 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0751  putative glutamate mutase mutL  34.07 
 
 
462 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2387  hypothetical protein  31.7 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030749  hitchhiker  0.000291133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2268  hypothetical protein  31.91 
 
 
469 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00276621  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0781  hypothetical protein  28.77 
 
 
613 aa  149  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0977  hypothetical protein  31.92 
 
 
443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3650  hypothetical protein  24.71 
 
 
610 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0192  hypothetical protein  20.95 
 
 
725 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00309311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2217  hypothetical protein  20.63 
 
 
676 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000677217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>