More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1121 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
458 aa  940    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  43.76 
 
 
443 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  42.2 
 
 
464 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  43.6 
 
 
434 aa  364  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  42.12 
 
 
454 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  43.16 
 
 
434 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  41.84 
 
 
434 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  41.09 
 
 
443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  42.93 
 
 
438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  43.57 
 
 
436 aa  353  4e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  42.92 
 
 
464 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  41.61 
 
 
434 aa  352  8e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  40.97 
 
 
444 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  40.97 
 
 
444 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  40.97 
 
 
444 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  40.97 
 
 
444 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  40.97 
 
 
444 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  40.97 
 
 
444 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  40.97 
 
 
444 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  40.97 
 
 
444 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  40.74 
 
 
444 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  40.76 
 
 
434 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  41.71 
 
 
444 aa  351  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  40.68 
 
 
443 aa  350  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  44.09 
 
 
441 aa  344  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  42.02 
 
 
446 aa  343  4e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  42.65 
 
 
434 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  39.57 
 
 
436 aa  339  7e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  43.59 
 
 
461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  41.03 
 
 
441 aa  335  7e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  43.69 
 
 
422 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  40.33 
 
 
421 aa  328  9e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  40.14 
 
 
443 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  38.39 
 
 
420 aa  319  7e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  42.92 
 
 
439 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  39.07 
 
 
426 aa  315  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  41.18 
 
 
436 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  39.02 
 
 
422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  39.39 
 
 
442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.86 
 
 
429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  38.79 
 
 
422 aa  312  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  40.59 
 
 
448 aa  310  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  40.59 
 
 
448 aa  310  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  41.11 
 
 
432 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  38.77 
 
 
418 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  39.73 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  38.33 
 
 
458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  36.62 
 
 
451 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  38.95 
 
 
425 aa  303  5.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  39.43 
 
 
414 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  38.53 
 
 
418 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  39.48 
 
 
419 aa  302  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  36.47 
 
 
420 aa  300  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  38.74 
 
 
453 aa  300  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  36.22 
 
 
446 aa  300  4e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  38.84 
 
 
443 aa  300  4e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  37.2 
 
 
434 aa  298  1e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  38.53 
 
 
440 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  36.99 
 
 
420 aa  298  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  38.15 
 
 
428 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  37.8 
 
 
418 aa  297  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  38.77 
 
 
418 aa  296  4e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  37.12 
 
 
425 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  39.59 
 
 
448 aa  295  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  38.24 
 
 
425 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  37.03 
 
 
416 aa  294  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  37.93 
 
 
450 aa  294  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  35.87 
 
 
416 aa  293  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  38.48 
 
 
422 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  38 
 
 
425 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  37.29 
 
 
430 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  36.64 
 
 
425 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  36.17 
 
 
425 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  36.41 
 
 
425 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  36.91 
 
 
421 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  36.73 
 
 
424 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  37.12 
 
 
422 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  36.66 
 
 
432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  36.91 
 
 
434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  36.66 
 
 
432 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  36.66 
 
 
432 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  36.66 
 
 
434 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  36.66 
 
 
434 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  36.66 
 
 
434 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  36.66 
 
 
434 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  35.94 
 
 
446 aa  286  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  37.85 
 
 
428 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  36.92 
 
 
408 aa  285  9e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  38.57 
 
 
434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.04 
 
 
423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  35.58 
 
 
432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  36.08 
 
 
440 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  39.12 
 
 
459 aa  283  6.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  36 
 
 
455 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  35.98 
 
 
449 aa  281  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  38.26 
 
 
428 aa  281  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  37.23 
 
 
450 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  34.86 
 
 
428 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  36.28 
 
 
443 aa  280  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  36.28 
 
 
443 aa  280  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>