267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1083 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  100 
 
 
368 aa  724    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  57.65 
 
 
580 aa  422  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  46.89 
 
 
185 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  50.86 
 
 
177 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14330  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.15 
 
 
186 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000378736  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.57 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  33.15 
 
 
201 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  30.32 
 
 
189 aa  84.7  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0686  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30 
 
 
211 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320236  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18790  FMN-binding domain protein  34.5 
 
 
251 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  31.02 
 
 
715 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.4 
 
 
178 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2404  electron transport complex protein RnfG  26.67 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.59015  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2682  FMN-binding domain protein  50.59 
 
 
725 aa  76.6  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000182081  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.33 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1159  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.39 
 
 
222 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1312  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.35 
 
 
181 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.777604  normal  0.23386 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.04 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1707  electron transport complex protein RnfG  32.58 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.116117  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  26.64 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0734  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.34 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1553  electron transport complex protein RnfG  28.93 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18900  hypothetical protein  28.44 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0705821  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50940  Electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.55 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0444757  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2343  electron transport complex protein RnfG  32.58 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100314  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1489  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.4 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1719  electron transport complex protein RnfG  29.08 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1887  electron transport complex protein RnfG  29.08 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1568  electron transport complex protein RnfG  33.59 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172689  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1565  electron transport complex protein RnfG  29.08 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  normal  0.099042 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2010  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.59 
 
 
206 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00233582  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1820  electron transport complex protein RnfG  33.59 
 
 
206 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.953623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1625  electron transport complex protein RnfG  28.57 
 
 
206 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.469993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  30 
 
 
453 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1839  electron transport complex protein RnfG  33.59 
 
 
206 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00239547  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01601  electron transport complex protein RnfG  31.82 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00338935  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1998  electron transport complex protein RnfG  31.82 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0210205  normal  0.220533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.89 
 
 
193 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01591  hypothetical protein  31.82 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00493917  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1325  FMN-binding domain protein  29.24 
 
 
181 aa  71.6  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000405195  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1157  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.64 
 
 
181 aa  72  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2021  electron transport complex protein RnfG  27.88 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0934  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.53 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.8 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.42 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  29.57 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2019  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.94 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1382  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.12 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000652446  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  35.51 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  35.51 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1400  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.65 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  35.51 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2061  electron transport complex protein RnfG  36.45 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000406522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2512  electron transport complex protein RnfG  35.51 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2011  electron transport complex protein RnfG  31.58 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000172244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2249  electron transport complex protein RnfG  31.58 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000657737  normal  0.472384 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  46.59 
 
 
599 aa  70.1  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1899  electron transport complex protein RnfG  31.58 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00381532  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2923  FMN-binding domain protein  42.53 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  26.67 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2321  electron transport complex protein RnfG  29.21 
 
 
209 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2006  FMN-binding domain protein  31.06 
 
 
484 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600004  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1636  hypothetical protein  35.65 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2277  electron transport complex protein RnfG  35.51 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.050891  normal  0.93229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2357  electron transport complex protein RnfG  32 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2108  electron transport complex protein RnfG  35.51 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.220327  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1846  electron transport complex protein RnfG  34.58 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000030729  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4549  electron transport complex protein RnfG  35.51 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2263  electron transport complex protein RnfG  35.51 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3196  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.1 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1032  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.4 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480333  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2560  electron transport complex protein RnfG  25.37 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0486766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1538  FMN-binding domain protein  40.23 
 
 
118 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.628376  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  42.11 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3935  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.1 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00699897  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1868  electron transport complex protein RnfG  29.49 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803831  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2820  electron transport complex, G subunit  35.2 
 
 
230 aa  67  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  32.12 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2158  electron transport complex protein RnfG  26.11 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.915166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  27.34 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2117  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  49.4 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  40 
 
 
173 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  40 
 
 
173 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2176  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.04 
 
 
215 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0534  electron transport complex protein RnfG  34.65 
 
 
209 aa  65.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000007202  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0722  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.59 
 
 
224 aa  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271576  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1817  electron transport complex protein RnfG  30.3 
 
 
206 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0386367  decreased coverage  0.000324023 
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  31.06 
 
 
572 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19230  Electron transport complex, subunit G  33.03 
 
 
208 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1920  electron transport complex protein RnfG  29.08 
 
 
211 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2040  electron transport complex protein RnfG  33.64 
 
 
208 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.8254  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2236  electron transport complex protein RnfG  30.83 
 
 
209 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000312896 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.31 
 
 
233 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0530  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.16 
 
 
196 aa  64.3  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2070  electron transport complex protein RnfG  27.18 
 
 
212 aa  63.9  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1240  FMN-binding domain protein  28.49 
 
 
192 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02968  electron transport complex protein RnfG  28.72 
 
 
212 aa  63.5  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1958  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.31 
 
 
193 aa  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.537285  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.71 
 
 
220 aa  63.2  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  28.02 
 
 
199 aa  63.2  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>