More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1058 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  47.06 
 
 
201 aa  175  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  47.06 
 
 
201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  38.97 
 
 
218 aa  141  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
198 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  31.98 
 
 
197 aa  118  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  34.03 
 
 
193 aa  117  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  32.58 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  34.44 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  31.12 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  32.78 
 
 
191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  31.38 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  32.57 
 
 
183 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  32.57 
 
 
183 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  32.57 
 
 
183 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  33.73 
 
 
186 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  32.93 
 
 
183 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  30.68 
 
 
183 aa  101  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  28.74 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  27.14 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  26.09 
 
 
218 aa  79  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  30.95 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  28.8 
 
 
870 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  39.68 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  26.78 
 
 
727 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  27.96 
 
 
214 aa  72  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  33.97 
 
 
213 aa  72  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  27.94 
 
 
233 aa  71.2  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  28.49 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  26.4 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  27.93 
 
 
363 aa  69.7  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  29.33 
 
 
600 aa  69.7  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  25.5 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  22.99 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  26.01 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  27.57 
 
 
264 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  25 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  25.37 
 
 
215 aa  67.8  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 
710 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  26.7 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  26.67 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  25.99 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  27.66 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  28.14 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  25.76 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  26.77 
 
 
242 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  26.06 
 
 
567 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  28.04 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  27.14 
 
 
234 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  32.05 
 
 
521 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  25.52 
 
 
245 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  27.68 
 
 
171 aa  63.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  28.02 
 
 
389 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  25 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  26.54 
 
 
261 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  27.38 
 
 
449 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  29.71 
 
 
351 aa  62.8  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  23.88 
 
 
193 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
190 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  29.01 
 
 
358 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  27.08 
 
 
260 aa  62.4  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  27.97 
 
 
343 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  27.97 
 
 
343 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  35.19 
 
 
213 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  26.2 
 
 
862 aa  62  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  26.54 
 
 
416 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  26.83 
 
 
225 aa  61.6  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  25.51 
 
 
336 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  25.5 
 
 
267 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  25.51 
 
 
336 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  28.14 
 
 
186 aa  61.6  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  29.09 
 
 
1033 aa  61.2  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  29.34 
 
 
266 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  26.7 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  26.74 
 
 
230 aa  60.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  25.5 
 
 
846 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  25.15 
 
 
268 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  25.23 
 
 
844 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  25.42 
 
 
517 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.82 
 
 
14916 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  45.12 
 
 
830 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  26.86 
 
 
309 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  24.86 
 
 
233 aa  60.1  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  26.35 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  23.44 
 
 
215 aa  59.3  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  32.79 
 
 
194 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  34.38 
 
 
175 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  27 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  28.08 
 
 
191 aa  59.3  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  25.98 
 
 
354 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  25.61 
 
 
199 aa  58.9  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  31.76 
 
 
234 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  31.76 
 
 
234 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  24.51 
 
 
211 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  25.49 
 
 
190 aa  58.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  26.44 
 
 
311 aa  58.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  24.39 
 
 
216 aa  58.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  24.51 
 
 
211 aa  58.2  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>