54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1028 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 111 aa  229  9e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  38.14 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0499  nucleotidyltransferase domain-containing protein  38.14 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  34.91 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  29.9 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  31.96 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  30.1 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  31.07 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  36.73 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  34.48 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  34.02 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  29.81 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  33.68 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  32.38 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  31.46 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  27.45 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  31.37 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2669  DNA polymerase beta domain protein region  26.85 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  28.57 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  36.47 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  27.18 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  27.88 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  32.98 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1363  nucleotidyltransferase, putative  27 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00238094  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  31.48 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  30.63 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  30.63 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  30.63 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  29.13 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  34.04 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  32.38 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  32.04 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  30.1 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  26.92 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  32.53 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  32.32 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36.92 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  27.63 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  30.3 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3303  DNA polymerase beta domain protein region  23.71 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.433068 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  33.01 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  34.62 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  25.23 
 
 		 106 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  30.91 
 
 		 117 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2490  DNA polymerase beta domain protein region  26.72 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  28.77 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0146  nucleotidyltransferase family protein  35.9 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0363177  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  42.86 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  29.41 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3233  nucleotidyltransferase domain protein  26.42 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.73519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>