More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0991 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  100 
 
 
475 aa  943    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  40.4 
 
 
469 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  36.42 
 
 
461 aa  284  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  35.87 
 
 
458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  34.97 
 
 
464 aa  266  7e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  35.21 
 
 
472 aa  253  4.0000000000000004e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  36.67 
 
 
452 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  34.19 
 
 
453 aa  239  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  34.2 
 
 
446 aa  238  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  32.67 
 
 
438 aa  238  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  32.15 
 
 
467 aa  237  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  35.51 
 
 
462 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  35.42 
 
 
469 aa  229  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  30.95 
 
 
475 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  34.22 
 
 
464 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  31.58 
 
 
450 aa  226  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  34.07 
 
 
464 aa  224  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  33.63 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  33.41 
 
 
447 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  33.5 
 
 
453 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  30.93 
 
 
459 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  32.74 
 
 
483 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  32.14 
 
 
502 aa  204  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  29.44 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  33.87 
 
 
468 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  28.98 
 
 
446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  30.65 
 
 
461 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  33.33 
 
 
460 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  30.3 
 
 
470 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  32.74 
 
 
452 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  30.32 
 
 
474 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  28.41 
 
 
484 aa  192  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  28.41 
 
 
547 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  28.11 
 
 
495 aa  190  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  28.41 
 
 
547 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  28.41 
 
 
546 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  28.19 
 
 
546 aa  190  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  28.47 
 
 
484 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  29.74 
 
 
445 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  27.9 
 
 
495 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  29.89 
 
 
476 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  32.74 
 
 
452 aa  187  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  31.5 
 
 
478 aa  186  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  31 
 
 
475 aa  186  9e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  31.4 
 
 
475 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  29.26 
 
 
462 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  27.71 
 
 
463 aa  180  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.23 
 
 
486 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  31.47 
 
 
486 aa  177  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  30.48 
 
 
498 aa  176  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  32.26 
 
 
454 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  30.09 
 
 
408 aa  173  5e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  30.11 
 
 
461 aa  173  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  29.49 
 
 
499 aa  172  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  28.64 
 
 
474 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  28.64 
 
 
474 aa  171  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  27.05 
 
 
464 aa  170  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  29.85 
 
 
498 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  27.61 
 
 
468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.7 
 
 
500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  28.64 
 
 
476 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  26.55 
 
 
463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  27.38 
 
 
463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  29.08 
 
 
480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  28.87 
 
 
467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  27.38 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  27.38 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  27.38 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  27.38 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  27.38 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  27.38 
 
 
464 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25 
 
 
468 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  27.38 
 
 
464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  27.72 
 
 
450 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
456 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  27.35 
 
 
448 aa  163  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  27.15 
 
 
464 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  29.16 
 
 
443 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  29.08 
 
 
538 aa  162  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  29.63 
 
 
525 aa  160  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.51 
 
 
490 aa  160  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  27.8 
 
 
484 aa  158  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.49 
 
 
500 aa  156  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.39 
 
 
485 aa  156  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.49 
 
 
481 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.51 
 
 
485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.64 
 
 
554 aa  154  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.8 
 
 
518 aa  153  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  26.93 
 
 
450 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  29.48 
 
 
470 aa  152  8.999999999999999e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.06 
 
 
453 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  26 
 
 
457 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.2 
 
 
455 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  29.95 
 
 
434 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  27.01 
 
 
442 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  26.87 
 
 
445 aa  150  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  26.01 
 
 
454 aa  149  9e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  28.23 
 
 
453 aa  149  9e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  29.07 
 
 
477 aa  147  3e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  28.88 
 
 
446 aa  147  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>