More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0880 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 158 aa  322  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.46 
 
 		 160 aa  181  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.59 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  43.31 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.59 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  39.88 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  40.13 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  44.37 
 
 		 199 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  40.65 
 
 		 199 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  34.01 
 
 		 199 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  39.86 
 
 		 199 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  41.26 
 
 		 199 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  34.87 
 
 		 199 aa  100  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  40.14 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  36.36 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  36.36 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  40.14 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  40.85 
 
 		 200 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  35.86 
 
 		 199 aa  99.4  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  34.85 
 
 		 199 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0330  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.79 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4352  TrpR binding protein WrbA  39.16 
 
 		 199 aa  97.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0784  TrpR binding protein WrbA  39.87 
 
 		 199 aa  97.1  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  40.14 
 
 		 212 aa  97.1  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  37.42 
 
 		 199 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0978  TrpR binding protein WrbA  38.46 
 
 		 199 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.642178  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2810  TrpR binding protein WrbA  40.85 
 
 		 199 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  38.73 
 
 		 200 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  39.44 
 
 		 199 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5226  TrpR binding protein WrbA  38.03 
 
 		 203 aa  94.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  38.03 
 
 		 199 aa  94.4  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  31.5 
 
 		 201 aa  94  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  41.13 
 
 		 199 aa  93.6  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4332  flavoprotein WrbA  33.5 
 
 		 199 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  31.66 
 
 		 200 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  32.67 
 
 		 204 aa  91.7  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.46 
 
 		 198 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.55 
 
 		 198 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1594  TrpR binding protein WrbA  33.84 
 
 		 198 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.79 
 
 		 220 aa  91.7  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  38.73 
 
 		 208 aa  91.7  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  33.84 
 
 		 199 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.01 
 
 		 202 aa  89.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  32.66 
 
 		 200 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  31.94 
 
 		 201 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  35.92 
 
 		 200 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  31.94 
 
 		 201 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000168945 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  31.66 
 
 		 200 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  32.32 
 
 		 199 aa  87.8  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  31.66 
 
 		 200 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  36.62 
 
 		 200 aa  87.8  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  35.92 
 
 		 200 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  31.94 
 
 		 201 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.94 
 
 		 201 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  35.92 
 
 		 200 aa  87.4  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  34.16 
 
 		 198 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  34.16 
 
 		 198 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  34.16 
 
 		 198 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  32.98 
 
 		 198 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  34.16 
 
 		 198 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  34.16 
 
 		 198 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1014  TrpR binding protein WrbA  31.47 
 
 		 199 aa  85.9  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  34.16 
 
 		 198 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  38.03 
 
 		 200 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  38.03 
 
 		 200 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  33.66 
 
 		 198 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  33.66 
 
 		 198 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  38.03 
 
 		 201 aa  84.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  33.66 
 
 		 198 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  33.66 
 
 		 198 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  33.66 
 
 		 198 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  33.66 
 
 		 198 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  33.66 
 
 		 198 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0913  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.64 
 
 		 203 aa  84.3  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1049  TrpR binding protein WrbA  31.98 
 
 		 199 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2136  TrpR binding protein WrbA  31.31 
 
 		 199 aa  84.3  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  36.55 
 
 		 203 aa  84  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  32.18 
 
 		 204 aa  84  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  37.32 
 
 		 207 aa  84  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  32.46 
 
 		 198 aa  84  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  30.35 
 
 		 200 aa  84  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.45 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.96 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4139  flavoprotein WrbA  33.33 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000384114  unclonable  0.00000000000397831 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  34.36 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0899  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  31.96 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000786086 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  30.88 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  29.84 
 
 		 201 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  35.71 
 
 		 199 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  35.71 
 
 		 199 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  35.71 
 
 		 199 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  36.62 
 
 		 200 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  80.5  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1932  TrpR binding protein WrbA  31.82 
 
 		 199 aa  80.5  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  35.21 
 
 		 206 aa  80.5  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  31.68 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0384  flavoprotein WrbA  31.63 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0439  tryptophan repressor binding protein  31.63 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0737  flavoprotein WrbA  32.12 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.438501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  34.97 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>