216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0871 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  100 
 
 
380 aa  770    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  48.56 
 
 
381 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  53.24 
 
 
380 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  50.79 
 
 
379 aa  358  9e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  49.2 
 
 
382 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  51.19 
 
 
381 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  51.19 
 
 
381 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  50.53 
 
 
384 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  50.93 
 
 
408 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  50.93 
 
 
381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  50.93 
 
 
408 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  50.93 
 
 
381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  50.93 
 
 
381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  50.93 
 
 
381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  50.13 
 
 
381 aa  349  5e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  53.35 
 
 
380 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  50.13 
 
 
381 aa  347  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  50 
 
 
387 aa  346  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  48.4 
 
 
380 aa  344  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  47.58 
 
 
379 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  47.98 
 
 
383 aa  340  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  49.21 
 
 
381 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  48.81 
 
 
378 aa  339  4e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  48.81 
 
 
378 aa  339  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  48.81 
 
 
378 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  49.46 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  48.14 
 
 
384 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  46.24 
 
 
379 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  49.71 
 
 
386 aa  332  6e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  46.3 
 
 
379 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  48.54 
 
 
380 aa  332  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  48.3 
 
 
392 aa  331  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  48.54 
 
 
380 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  48.54 
 
 
380 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  48.12 
 
 
380 aa  331  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  48.54 
 
 
380 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  47.28 
 
 
383 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  47.3 
 
 
373 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  47.3 
 
 
373 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  48.4 
 
 
379 aa  327  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  48.28 
 
 
380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  49.19 
 
 
381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  48.12 
 
 
377 aa  325  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  48.54 
 
 
384 aa  323  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  45.97 
 
 
379 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  47.04 
 
 
378 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  47.37 
 
 
381 aa  320  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  46.84 
 
 
381 aa  318  7e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  46.4 
 
 
388 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  46.79 
 
 
394 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  45.62 
 
 
379 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  44.15 
 
 
382 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  44.15 
 
 
382 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  47.07 
 
 
377 aa  317  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  45.36 
 
 
381 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  46.15 
 
 
379 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  46.15 
 
 
379 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  46.15 
 
 
379 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  46.15 
 
 
379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  47.01 
 
 
381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  44.56 
 
 
381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  43.88 
 
 
382 aa  312  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  43.88 
 
 
382 aa  312  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  45.97 
 
 
378 aa  312  6.999999999999999e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  45.43 
 
 
381 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  47 
 
 
384 aa  311  9e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  45.36 
 
 
379 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  47.3 
 
 
380 aa  310  4e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  45.1 
 
 
394 aa  310  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  45.43 
 
 
378 aa  308  9e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  46.32 
 
 
381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  46.84 
 
 
381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  43.65 
 
 
378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  44.28 
 
 
403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  47.76 
 
 
384 aa  306  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  47.28 
 
 
379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  46.17 
 
 
381 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  44.14 
 
 
402 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0579  glycerate kinase  47.01 
 
 
353 aa  305  6e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.513033  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  45.04 
 
 
380 aa  305  9.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  45.04 
 
 
380 aa  305  9.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  47.04 
 
 
378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  43.39 
 
 
402 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  45.04 
 
 
380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  46.2 
 
 
381 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1570  glycerate kinase  44.5 
 
 
403 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.769204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  46.2 
 
 
381 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  43.27 
 
 
380 aa  300  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  45.92 
 
 
385 aa  300  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  46.47 
 
 
381 aa  299  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  43.68 
 
 
381 aa  298  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  45.65 
 
 
385 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4561  glycerate kinase  42.59 
 
 
387 aa  298  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.532738 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  41.91 
 
 
388 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  41.91 
 
 
388 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  41.91 
 
 
388 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  41.91 
 
 
394 aa  296  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  44.89 
 
 
381 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  44.03 
 
 
389 aa  294  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0185  glycerate kinase  46.2 
 
 
381 aa  292  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>