More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0809 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  45.4 
 
 
819 aa  691    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  100 
 
 
815 aa  1660    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  24.51 
 
 
697 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  26.37 
 
 
708 aa  147  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  24.7 
 
 
716 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  24.44 
 
 
662 aa  145  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.44 
 
 
696 aa  144  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  27.06 
 
 
712 aa  138  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  24.57 
 
 
710 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  25.1 
 
 
711 aa  135  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  25 
 
 
706 aa  134  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  24.25 
 
 
696 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  24.49 
 
 
699 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  26.48 
 
 
690 aa  133  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  23.99 
 
 
695 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  25.1 
 
 
703 aa  127  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  25.1 
 
 
703 aa  127  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  32.1 
 
 
612 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  22.69 
 
 
673 aa  127  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  24.69 
 
 
671 aa  126  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  29.15 
 
 
615 aa  124  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  24.7 
 
 
759 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  24.01 
 
 
695 aa  118  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  22.57 
 
 
603 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  22.64 
 
 
705 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  22.81 
 
 
712 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  44.37 
 
 
207 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  25.15 
 
 
704 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  25.15 
 
 
704 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.15 
 
 
704 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  26.64 
 
 
601 aa  112  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  42.95 
 
 
207 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  30.4 
 
 
619 aa  111  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  22.88 
 
 
752 aa  111  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  23.41 
 
 
734 aa  110  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  22.38 
 
 
679 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  39.81 
 
 
222 aa  107  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  25.15 
 
 
705 aa  107  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  38.98 
 
 
203 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  24.49 
 
 
714 aa  106  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  27.11 
 
 
607 aa  106  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  38.98 
 
 
203 aa  105  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  25.96 
 
 
702 aa  105  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  27.82 
 
 
625 aa  105  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  29.33 
 
 
619 aa  103  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  51.2 
 
 
209 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  24.38 
 
 
737 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  22.27 
 
 
700 aa  103  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  20.7 
 
 
659 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  42.54 
 
 
275 aa  103  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  46.09 
 
 
230 aa  101  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  43.75 
 
 
201 aa  101  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  47.86 
 
 
235 aa  100  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  29.7 
 
 
593 aa  100  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  47.2 
 
 
215 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  47.2 
 
 
213 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.53 
 
 
212 aa  99  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.07 
 
 
204 aa  99.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.9 
 
 
205 aa  99  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  25.73 
 
 
564 aa  98.6  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  42.11 
 
 
204 aa  98.6  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.9 
 
 
201 aa  98.2  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  45.38 
 
 
238 aa  98.2  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  23.47 
 
 
809 aa  98.2  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.16 
 
 
200 aa  98.6  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  27.82 
 
 
632 aa  97.8  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.31 
 
 
207 aa  97.8  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.65 
 
 
212 aa  97.8  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  41.33 
 
 
204 aa  97.4  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  39.85 
 
 
232 aa  97.4  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.84 
 
 
197 aa  96.7  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.97 
 
 
201 aa  96.3  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.64 
 
 
737 aa  96.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  44.8 
 
 
201 aa  95.5  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  41.86 
 
 
269 aa  95.9  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  41.86 
 
 
269 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  22.49 
 
 
685 aa  95.5  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  41.94 
 
 
253 aa  95.5  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.91 
 
 
252 aa  95.1  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  41.86 
 
 
223 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  41.86 
 
 
223 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  37.16 
 
 
197 aa  95.1  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  41.86 
 
 
206 aa  94.7  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  41.86 
 
 
206 aa  94.7  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  41.86 
 
 
206 aa  94.7  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.65 
 
 
222 aa  94.7  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  41.86 
 
 
206 aa  94.7  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  41.86 
 
 
223 aa  94.7  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  38.31 
 
 
210 aa  94.7  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  40.88 
 
 
206 aa  94.4  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  26.67 
 
 
610 aa  94.4  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.48 
 
 
231 aa  94.4  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  40.44 
 
 
236 aa  94.4  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  44 
 
 
203 aa  94  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.74 
 
 
229 aa  92.8  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  45.56 
 
 
1032 aa  93.2  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  37.16 
 
 
217 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.8 
 
 
207 aa  92.4  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  43.55 
 
 
263 aa  92.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  42.02 
 
 
233 aa  92  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>