More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0732 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
138 aa  276  9e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  57.14 
 
 
126 aa  144  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 
138 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  52.17 
 
 
126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  44.83 
 
 
128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  42.61 
 
 
125 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
139 aa  102  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  43.7 
 
 
139 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  43.7 
 
 
139 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  43.7 
 
 
139 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  43.7 
 
 
139 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  43.7 
 
 
139 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  43.7 
 
 
139 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  43.09 
 
 
139 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
139 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  42.15 
 
 
139 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  42.15 
 
 
139 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  42.98 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
124 aa  87.4  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  37.61 
 
 
129 aa  84  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  43.04 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  41 
 
 
482 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
482 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  41 
 
 
482 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  41 
 
 
477 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  41 
 
 
482 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  41 
 
 
482 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
118 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
482 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  44.9 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  46.25 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  36.67 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
482 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  40 
 
 
482 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  39 
 
 
482 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  39.02 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  39.02 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  47.06 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  40.2 
 
 
305 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 
129 aa  77  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 
126 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  38.02 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  42.99 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2650  transcriptional regulator, putative  46.75 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  35.65 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  35.65 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  41.3 
 
 
321 aa  74.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  48.68 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  45.33 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  31.5 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  47.95 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
498 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  31.09 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  35.43 
 
 
129 aa  72  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 
126 aa  72  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1803  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  46.58 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  47.76 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  33.9 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  30.25 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4189  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
123 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  44.3 
 
 
464 aa  68.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  31.93 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0356  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
520 aa  68.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.716166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>