242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0652 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  100 
 
 
580 aa  1132    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  57.65 
 
 
368 aa  385  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  49.14 
 
 
185 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  56.4 
 
 
177 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.92 
 
 
344 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18790  FMN-binding domain protein  33.65 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  28.08 
 
 
715 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2006  FMN-binding domain protein  28.36 
 
 
484 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600004  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  30 
 
 
201 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2682  FMN-binding domain protein  53.57 
 
 
725 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000182081  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  30.06 
 
 
201 aa  78.6  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14330  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.09 
 
 
186 aa  76.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000378736  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.35 
 
 
197 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2019  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.2 
 
 
216 aa  75.5  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2923  FMN-binding domain protein  38.71 
 
 
118 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50940  Electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.57 
 
 
229 aa  72.4  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0444757  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.53 
 
 
193 aa  72  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1538  FMN-binding domain protein  37.78 
 
 
118 aa  70.9  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.628376  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1312  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.91 
 
 
181 aa  69.7  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.777604  normal  0.23386 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.12 
 
 
185 aa  69.7  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1325  FMN-binding domain protein  27.06 
 
 
181 aa  69.3  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000405195  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2070  electron transport complex protein RnfG  30.13 
 
 
212 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  27.81 
 
 
220 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  45 
 
 
599 aa  67.8  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2117  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  46.99 
 
 
169 aa  67.8  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2040  electron transport complex protein RnfG  26.32 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.8254  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.73 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  31.36 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.27 
 
 
220 aa  67  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  42.05 
 
 
517 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2277  electron transport complex protein RnfG  27.32 
 
 
212 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.050891  normal  0.93229 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0686  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.89 
 
 
211 aa  66.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320236  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0722  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.49 
 
 
224 aa  66.6  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271576  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  40.82 
 
 
603 aa  67  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1382  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28 
 
 
190 aa  65.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000652446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  32.48 
 
 
453 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2139  FMN-binding domain protein  39.08 
 
 
123 aa  66.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18900  hypothetical protein  25.38 
 
 
214 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0705821  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2404  electron transport complex protein RnfG  25 
 
 
215 aa  65.1  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.59015  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  32.79 
 
 
389 aa  64.7  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1707  electron transport complex protein RnfG  29.51 
 
 
206 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.116117  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.61 
 
 
233 aa  64.3  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  33.03 
 
 
1004 aa  63.9  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14850  hypothetical protein  26.92 
 
 
228 aa  63.9  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000151684  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2021  electron transport complex protein RnfG  29.32 
 
 
209 aa  63.9  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  32.99 
 
 
1005 aa  63.5  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2010  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.51 
 
 
206 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00233582  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.33 
 
 
259 aa  63.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648995  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1489  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.32 
 
 
229 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  43.42 
 
 
173 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1171  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.18 
 
 
210 aa  63.5  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1820  electron transport complex protein RnfG  29.51 
 
 
206 aa  63.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.953623  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1568  electron transport complex protein RnfG  29.51 
 
 
206 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172689  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2343  electron transport complex protein RnfG  28.57 
 
 
206 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100314  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  40.54 
 
 
173 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  40.54 
 
 
173 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1839  electron transport complex protein RnfG  29.51 
 
 
206 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00239547  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.32 
 
 
178 aa  62.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1553  electron transport complex protein RnfG  28.57 
 
 
206 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  33.94 
 
 
373 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2061  electron transport complex protein RnfG  26.37 
 
 
208 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000406522  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01601  electron transport complex protein RnfG  28.96 
 
 
206 aa  62  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00338935  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1157  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.74 
 
 
181 aa  62  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1719  electron transport complex protein RnfG  27.72 
 
 
206 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275661  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01591  hypothetical protein  28.96 
 
 
206 aa  62  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00493917  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1887  electron transport complex protein RnfG  27.72 
 
 
206 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0734  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.77 
 
 
211 aa  62  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1998  electron transport complex protein RnfG  28.96 
 
 
206 aa  62  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0210205  normal  0.220533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1565  electron transport complex protein RnfG  27.72 
 
 
206 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  normal  0.099042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  39.51 
 
 
171 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1867  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  24.62 
 
 
217 aa  61.6  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1625  electron transport complex protein RnfG  27.23 
 
 
206 aa  61.6  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.469993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2357  electron transport complex protein RnfG  26.13 
 
 
207 aa  61.2  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1159  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.62 
 
 
222 aa  61.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1102  FMN-binding domain protein  38.82 
 
 
126 aa  61.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2560  electron transport complex protein RnfG  25.12 
 
 
208 aa  61.2  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0486766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1920  electron transport complex protein RnfG  25.47 
 
 
211 aa  60.8  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  28.02 
 
 
189 aa  60.5  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  26.92 
 
 
393 aa  60.8  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  36.11 
 
 
626 aa  60.8  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1846  electron transport complex protein RnfG  35.24 
 
 
208 aa  60.8  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000030729  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0986  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.1 
 
 
181 aa  60.5  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625397  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2321  electron transport complex protein RnfG  28.27 
 
 
209 aa  60.5  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2340  FMN-binding domain-containing protein  40.48 
 
 
120 aa  60.1  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0930241  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  36.9 
 
 
168 aa  60.1  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3196  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.38 
 
 
219 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  38.2 
 
 
597 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  35.71 
 
 
208 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0934  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.2 
 
 
233 aa  60.1  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2108  electron transport complex protein RnfG  26.37 
 
 
208 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.220327  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4549  electron transport complex protein RnfG  26.37 
 
 
208 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3935  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.38 
 
 
219 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00699897  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2263  electron transport complex protein RnfG  26.37 
 
 
208 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2512  electron transport complex protein RnfG  33.93 
 
 
212 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1713  FMN-binding domain protein  37.78 
 
 
702 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  33.93 
 
 
208 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  33.93 
 
 
208 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2236  electron transport complex protein RnfG  26.46 
 
 
209 aa  59.3  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000312896 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1868  electron transport complex protein RnfG  30 
 
 
210 aa  59.3  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803831  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  41.98 
 
 
591 aa  59.3  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>