More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0606 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
200 aa  414  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 
189 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 
216 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 
216 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 
216 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  32.31 
 
 
210 aa  101  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.1 
 
 
214 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 
203 aa  89.4  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  31.15 
 
 
179 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  30.6 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  30.6 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  31.15 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  30.6 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 
199 aa  87  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  30.6 
 
 
179 aa  86.3  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  30.6 
 
 
179 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 
185 aa  85.1  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  30.6 
 
 
179 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  33.72 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  30.05 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2002  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0995803  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  29.49 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  27.13 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  31.14 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  30.07 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 
190 aa  79  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  33.13 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 
235 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 
264 aa  78.6  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  35.25 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  27.6 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  35.97 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  27.05 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  28.76 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 
195 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  28.16 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  28.43 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  34.34 
 
 
172 aa  74.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  27.67 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  26.86 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  30.51 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  25.82 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  27.7 
 
 
266 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  26.29 
 
 
244 aa  72  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 
210 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
239 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 
329 aa  71.2  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  27.5 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  27.01 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  25.77 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  29.89 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  29.89 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  29.89 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  26.87 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  26.7 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  25.63 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  25.74 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  27.04 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  27.43 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  28.49 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  28.49 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  26.32 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  27.85 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  28.49 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  28.49 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  25.36 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  28.49 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  28.25 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  28.25 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  28.25 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  28.25 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  28.25 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  28.25 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  28.25 
 
 
285 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  26.07 
 
 
233 aa  68.2  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  28.25 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  38.53 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  27.78 
 
 
285 aa  68.2  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 
230 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  25 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>