292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0572 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  100 
 
 
325 aa  674    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  63.23 
 
 
318 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  59.18 
 
 
317 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11990  radical SAM protein, TIGR01212 family  53.65 
 
 
318 aa  361  9e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000013437  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0370  putative radical SAM protein  51.95 
 
 
313 aa  360  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2203  hypothetical protein  48.87 
 
 
314 aa  343  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0407  putative radical SAM protein  54.1 
 
 
303 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.145155  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0422  putative radical SAM protein  53.77 
 
 
303 aa  318  7e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1565  putative radical SAM protein  51.19 
 
 
300 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.705687  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0890  hypothetical protein  47.52 
 
 
315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.896383  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  47.97 
 
 
293 aa  286  4e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  44.08 
 
 
304 aa  268  7e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  39.73 
 
 
306 aa  248  9e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  36.48 
 
 
328 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  36.89 
 
 
311 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  38.03 
 
 
319 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  37.42 
 
 
310 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  38.89 
 
 
319 aa  235  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  38.89 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3853  hypothetical protein  39.46 
 
 
311 aa  232  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000731814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  38.89 
 
 
318 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3769  conserved hypothetical radical SAM protein  39.2 
 
 
321 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  37.06 
 
 
319 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0367  radical SAM family protein  35.97 
 
 
305 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0395363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4119  putative radical SAM protein  38.46 
 
 
305 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0103  putative radical SAM protein  37.75 
 
 
304 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0139654 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0964  putative radical SAM protein  36.45 
 
 
311 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  38.28 
 
 
307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0609  putative radical SAM protein  36.67 
 
 
331 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.165086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  37.05 
 
 
313 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  35.31 
 
 
307 aa  223  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0408  putative radical SAM protein  35.39 
 
 
313 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  37.29 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  37.29 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  36.62 
 
 
318 aa  219  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1320  hypothetical protein  35.33 
 
 
317 aa  215  8e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2603  radical SAM superfamily protein  36.75 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2769  hypothetical protein  35.53 
 
 
320 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0254774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2080  hypothetical protein  35.78 
 
 
316 aa  210  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1850  hypothetical protein  32.9 
 
 
317 aa  208  9e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013981  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3422  putative radical SAM protein  33.88 
 
 
319 aa  208  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1815  hypothetical protein  32.9 
 
 
317 aa  208  9e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.501711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0376  hypothetical protein TIGR01212  33.55 
 
 
319 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  32.4 
 
 
368 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4861  conserved hypothetical protein TIGR01212  33.55 
 
 
319 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4892  hypothetical protein  33.88 
 
 
319 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4499  Fe-S oxidoreductase  33.55 
 
 
319 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4481  Fe-S oxidoreductase  33.55 
 
 
319 aa  205  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4646  hypothetical protein  33.55 
 
 
319 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5001  hypothetical protein  33.55 
 
 
319 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4885  conserved hypothetical protein TIGR01212  33.55 
 
 
319 aa  205  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4579  putative radical SAM protein  33.22 
 
 
319 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4871  conserved hypothetical protein TIGR01212  33.22 
 
 
319 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1418  conserved hypothetical radical SAM protein  35.46 
 
 
312 aa  202  6e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1611  radical SAM superfamily protein  34.87 
 
 
314 aa  200  3e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.586759  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  32.89 
 
 
372 aa  195  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  36.86 
 
 
341 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  33.44 
 
 
309 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2022  hypothetical protein  31.7 
 
 
338 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4117  hypothetical protein  30.42 
 
 
334 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1403  hypothetical protein  33.99 
 
 
309 aa  190  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0317074  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  33.33 
 
 
309 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3355  hypothetical protein  31.56 
 
 
317 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.378299  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  33.45 
 
 
312 aa  190  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2870  putative radical SAM protein  33.45 
 
 
309 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00453128  normal  0.0632795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  33.45 
 
 
309 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  32.01 
 
 
351 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1014  putative radical SAM protein  32.67 
 
 
309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.531424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1127  putative radical SAM protein  31.34 
 
 
308 aa  182  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121319  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1137  putative radical SAM protein  32.41 
 
 
309 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00496914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  32.41 
 
 
330 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  34.32 
 
 
332 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1401  hypothetical protein  32.03 
 
 
311 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  32.07 
 
 
317 aa  179  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  34.32 
 
 
332 aa  178  9e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  31.36 
 
 
314 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2950  putative radical SAM protein  31.63 
 
 
322 aa  178  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.474173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  32.07 
 
 
309 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  31.72 
 
 
309 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1223  putative radical SAM protein  31.72 
 
 
309 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784754  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1005  hypothetical protein  34.11 
 
 
325 aa  176  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  34.32 
 
 
332 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  33.11 
 
 
319 aa  176  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  30.8 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  33.09 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  32.18 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1256  putative radical SAM protein  31.38 
 
 
309 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0785555  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0858  hypothetical protein  31.51 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  32.23 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  30.43 
 
 
309 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1087  radical SAM family protein  30.16 
 
 
311 aa  172  1e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.447962 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  32.53 
 
 
314 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  31.99 
 
 
564 aa  170  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  29.69 
 
 
329 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2223  hypothetical protein  33.89 
 
 
329 aa  169  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  29.69 
 
 
307 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0165  hypothetical protein  29.04 
 
 
347 aa  169  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.375388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  31.25 
 
 
320 aa  168  9e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.577174 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  30.8 
 
 
309 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  30.8 
 
 
309 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>