More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0509 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
748 aa  1503    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 
500 aa  280  7e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0918  NADH dehydrogenase (quinone)  31.84 
 
 
559 aa  228  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  33.79 
 
 
1265 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0845  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.84 
 
 
698 aa  218  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  36.36 
 
 
671 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  34.71 
 
 
1264 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  30.88 
 
 
1265 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  32.73 
 
 
674 aa  209  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.05 
 
 
525 aa  205  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.17 
 
 
513 aa  205  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0955  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.26 
 
 
523 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00424687  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.49 
 
 
522 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.19 
 
 
499 aa  200  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  33.7 
 
 
669 aa  200  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.68 
 
 
997 aa  198  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  33.08 
 
 
673 aa  196  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  32.6 
 
 
673 aa  196  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  27.99 
 
 
662 aa  194  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  33.1 
 
 
672 aa  194  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  34.18 
 
 
672 aa  194  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  32.7 
 
 
679 aa  194  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  33.92 
 
 
672 aa  193  8e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  34.18 
 
 
672 aa  193  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  34.18 
 
 
672 aa  193  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  34.18 
 
 
672 aa  193  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.1 
 
 
967 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2787  NADH dehydrogenase (quinone)  31.91 
 
 
633 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2795  NADH dehydrogenase (quinone)  31.91 
 
 
633 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  32.12 
 
 
683 aa  192  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  35.96 
 
 
1245 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0790  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.64 
 
 
500 aa  189  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  32.79 
 
 
470 aa  189  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.77 
 
 
959 aa  189  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.63 
 
 
952 aa  188  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  31.82 
 
 
585 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2288  NADH dehydrogenase (quinone)  31.48 
 
 
488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  30.28 
 
 
649 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.57 
 
 
973 aa  185  3e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.44 
 
 
661 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1606  NADH dehydrogenase subunit M  32.04 
 
 
626 aa  184  7e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.25 
 
 
566 aa  184  7e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479761  normal  0.594337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  32.25 
 
 
499 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  34.55 
 
 
687 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.64 
 
 
966 aa  183  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.07 
 
 
507 aa  183  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  30.75 
 
 
480 aa  183  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  33.1 
 
 
1253 aa  183  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.59 
 
 
688 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2662  NADH dehydrogenase (quinone)  30.02 
 
 
503 aa  181  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  29.57 
 
 
672 aa  181  4e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0812  NADH dehydrogenase (quinone)  31.17 
 
 
503 aa  181  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.114491  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0483  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.68 
 
 
798 aa  181  5.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.514379 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.06 
 
 
971 aa  180  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.39 
 
 
943 aa  180  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1000  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.5 
 
 
507 aa  180  8e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.827251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2709  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.55 
 
 
786 aa  180  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  31.07 
 
 
655 aa  179  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3285  NADH dehydrogenase (quinone)  32.3 
 
 
496 aa  179  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0676667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  30.63 
 
 
480 aa  179  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  30.89 
 
 
662 aa  178  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3628  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.32 
 
 
487 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5081  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.83 
 
 
979 aa  177  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4616  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.83 
 
 
979 aa  177  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.641343  decreased coverage  0.000524948 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3446  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.24 
 
 
669 aa  177  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181891  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2966  NADH dehydrogenase (quinone)  31.09 
 
 
501 aa  177  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.278298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31 
 
 
980 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.66 
 
 
801 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.12 
 
 
788 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1010  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.7 
 
 
978 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246067  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.45 
 
 
975 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5152  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.69 
 
 
651 aa  175  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.6 
 
 
972 aa  175  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  31.92 
 
 
637 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  32.93 
 
 
531 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3667  NADH dehydrogenase (quinone)  31.43 
 
 
496 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.66 
 
 
790 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  33.25 
 
 
737 aa  174  7.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0891  NADH dehydrogenase (quinone)  30.27 
 
 
493 aa  173  9e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.158004  normal  0.070736 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01550  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  28.71 
 
 
505 aa  173  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.38 
 
 
970 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  32.48 
 
 
577 aa  173  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  30.56 
 
 
473 aa  173  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.69 
 
 
969 aa  172  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.2 
 
 
932 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  30.96 
 
 
667 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.61 
 
 
800 aa  172  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305042  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  31.69 
 
 
748 aa  172  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.88 
 
 
1024 aa  172  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5156  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.82 
 
 
975 aa  171  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.36 
 
 
983 aa  171  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  29.79 
 
 
655 aa  171  7e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.18 
 
 
969 aa  170  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.14 
 
 
971 aa  170  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.126065 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  29.61 
 
 
501 aa  170  9e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3954  NADH dehydrogenase (quinone)  30.53 
 
 
497 aa  170  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  31.64 
 
 
646 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3310  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.7 
 
 
966 aa  170  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90946  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  31.71 
 
 
654 aa  170  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  30.28 
 
 
554 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>