More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0467 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  100 
 
 
454 aa  941    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  40.93 
 
 
460 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  41.96 
 
 
454 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  41.52 
 
 
458 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  41.52 
 
 
458 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  41.52 
 
 
458 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  41.52 
 
 
458 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  41.74 
 
 
458 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  41.74 
 
 
454 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  42.98 
 
 
459 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  41.29 
 
 
458 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  41.15 
 
 
458 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  41.29 
 
 
458 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  41.03 
 
 
457 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  41.22 
 
 
457 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  40.53 
 
 
453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  41.74 
 
 
454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  39.02 
 
 
453 aa  352  8e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  39.02 
 
 
453 aa  352  8e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  38.85 
 
 
455 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  38.85 
 
 
455 aa  343  4e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  37.47 
 
 
460 aa  341  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  38.15 
 
 
459 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  38.15 
 
 
459 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  41.7 
 
 
458 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  37.84 
 
 
459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  37.84 
 
 
459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.84 
 
 
459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.84 
 
 
459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  37.92 
 
 
459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  37.78 
 
 
459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.56 
 
 
459 aa  335  7e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  37.8 
 
 
456 aa  335  1e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  37.78 
 
 
459 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  37.39 
 
 
458 aa  333  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  37.25 
 
 
467 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  37.64 
 
 
460 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  38.36 
 
 
459 aa  323  4e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  38.6 
 
 
436 aa  319  5e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  36.54 
 
 
468 aa  316  4e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  37.92 
 
 
453 aa  312  9e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  35.25 
 
 
453 aa  309  6.999999999999999e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  37.11 
 
 
448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  36.71 
 
 
473 aa  304  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  36.59 
 
 
464 aa  299  7e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  36.95 
 
 
439 aa  295  8e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  34.95 
 
 
465 aa  293  4e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  34.62 
 
 
451 aa  291  2e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  36.3 
 
 
451 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  33.78 
 
 
451 aa  289  9e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  34.59 
 
 
496 aa  282  7.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  35.07 
 
 
457 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  33.04 
 
 
456 aa  272  1e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  32.31 
 
 
460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.75 
 
 
485 aa  266  5e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  33.03 
 
 
447 aa  263  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.81 
 
 
455 aa  263  6e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  34.82 
 
 
458 aa  261  2e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  33.33 
 
 
572 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  31.92 
 
 
461 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  31.92 
 
 
461 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  32.96 
 
 
468 aa  258  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  35.46 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  34.12 
 
 
554 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  33.63 
 
 
419 aa  252  8.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  31.47 
 
 
449 aa  251  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  30.56 
 
 
489 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  32.29 
 
 
460 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  33.49 
 
 
438 aa  250  4e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  30.82 
 
 
488 aa  249  6e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  32.96 
 
 
462 aa  248  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.02 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  34.32 
 
 
439 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  30.97 
 
 
462 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0451  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.8 
 
 
463 aa  242  7.999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.450901  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.51 
 
 
513 aa  242  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.43 
 
 
477 aa  241  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  31.04 
 
 
455 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  30.87 
 
 
476 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  30.79 
 
 
457 aa  240  4e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.83 
 
 
493 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  31.01 
 
 
470 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  31.36 
 
 
478 aa  236  7e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  29.42 
 
 
476 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.4 
 
 
450 aa  233  5e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  31.7 
 
 
471 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  32.05 
 
 
397 aa  232  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  32.73 
 
 
419 aa  229  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  28.78 
 
 
488 aa  229  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  28.78 
 
 
482 aa  229  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  30.37 
 
 
481 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  29.91 
 
 
480 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  30.73 
 
 
495 aa  228  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  30.72 
 
 
471 aa  226  6e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  30.2 
 
 
479 aa  225  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  30.19 
 
 
465 aa  224  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  32.36 
 
 
446 aa  225  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  29.8 
 
 
457 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0571  RNA methyltransferase, TrmA family  29.62 
 
 
473 aa  224  3e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  30.16 
 
 
451 aa  222  9e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>