More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0461 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.5 
 
 
730 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.99 
 
 
729 aa  643    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.51 
 
 
747 aa  650    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.64 
 
 
751 aa  648    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  46.85 
 
 
753 aa  644    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  46.51 
 
 
751 aa  644    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47.15 
 
 
725 aa  638    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.51 
 
 
751 aa  644    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.5 
 
 
730 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  100 
 
 
726 aa  1501    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.64 
 
 
747 aa  647    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.64 
 
 
751 aa  647    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47.86 
 
 
741 aa  649    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.56 
 
 
753 aa  641    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47.9 
 
 
732 aa  663    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47.38 
 
 
741 aa  642    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.77 
 
 
753 aa  649    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.35 
 
 
747 aa  632  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.49 
 
 
785 aa  632  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.95 
 
 
729 aa  622  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.2 
 
 
751 aa  624  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.07 
 
 
751 aa  620  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  44.16 
 
 
770 aa  621  1e-176  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.71 
 
 
759 aa  617  1e-175  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.52 
 
 
718 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.97 
 
 
730 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.06 
 
 
756 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.21 
 
 
758 aa  604  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  44.2 
 
 
739 aa  599  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.07 
 
 
757 aa  592  1e-168  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.64 
 
 
755 aa  594  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  44.47 
 
 
757 aa  592  1e-168  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.8 
 
 
711 aa  591  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  44.75 
 
 
707 aa  590  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.7 
 
 
715 aa  590  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.76 
 
 
748 aa  590  1e-167  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.35 
 
 
766 aa  590  1e-167  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  42.72 
 
 
744 aa  588  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.59 
 
 
737 aa  586  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.66 
 
 
742 aa  580  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  42.45 
 
 
736 aa  581  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.04 
 
 
831 aa  567  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.17 
 
 
768 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  41.2 
 
 
779 aa  561  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.81 
 
 
754 aa  561  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.05 
 
 
765 aa  556  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.93 
 
 
851 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  42.57 
 
 
731 aa  550  1e-155  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  42.32 
 
 
768 aa  552  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  43.07 
 
 
731 aa  551  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  44.91 
 
 
714 aa  551  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  42.88 
 
 
732 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.1 
 
 
763 aa  550  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.88 
 
 
857 aa  546  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.94 
 
 
773 aa  545  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.96 
 
 
829 aa  547  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  40.1 
 
 
807 aa  547  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.18 
 
 
838 aa  548  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  42.39 
 
 
762 aa  546  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.05 
 
 
786 aa  545  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.18 
 
 
694 aa  544  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.27 
 
 
772 aa  542  1e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  41.07 
 
 
762 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.35 
 
 
806 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  42.99 
 
 
746 aa  541  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  41.24 
 
 
759 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  41.66 
 
 
737 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.12 
 
 
797 aa  535  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.16 
 
 
738 aa  531  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  40.89 
 
 
738 aa  530  1e-149  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  41.77 
 
 
751 aa  531  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.01 
 
 
858 aa  530  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.03 
 
 
830 aa  529  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.24 
 
 
781 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.77 
 
 
762 aa  526  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.88 
 
 
858 aa  527  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  41.31 
 
 
738 aa  527  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  41.52 
 
 
696 aa  527  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  45.13 
 
 
705 aa  528  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.16 
 
 
837 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.05 
 
 
833 aa  519  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.26 
 
 
896 aa  520  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.21 
 
 
795 aa  520  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.28 
 
 
781 aa  519  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.05 
 
 
802 aa  521  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.64 
 
 
817 aa  518  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  40.34 
 
 
749 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.37 
 
 
794 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  38.65 
 
 
773 aa  514  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  38.76 
 
 
741 aa  510  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  40.49 
 
 
706 aa  510  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  40.16 
 
 
771 aa  510  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  39.81 
 
 
739 aa  510  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.51 
 
 
734 aa  510  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  39.89 
 
 
755 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  38.82 
 
 
789 aa  506  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.99 
 
 
772 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  39.39 
 
 
758 aa  507  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  43.23 
 
 
666 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.9 
 
 
775 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>