163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0364 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0519  DNA methylase N-4/N-6  53.74 
 
 
610 aa  655    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0364  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 
637 aa  1291    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000437677 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0582  DNA methylase N-4/N-6  47.39 
 
 
660 aa  585  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2179  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  48.21 
 
 
648 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1548  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  47.14 
 
 
611 aa  548  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2928  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  44.39 
 
 
624 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.537631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4205  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.84 
 
 
661 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0188789  normal  0.0659615 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1128  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  43.66 
 
 
643 aa  474  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0237  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.08 
 
 
626 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0154  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  42.46 
 
 
646 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1828  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  44.14 
 
 
632 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0787  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  42.44 
 
 
649 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0759094 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1394  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.93 
 
 
651 aa  430  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1521  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.36 
 
 
632 aa  422  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000681847  hitchhiker  0.000103984 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2487  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.1 
 
 
658 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.661764  normal  0.0354295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4593  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  39.21 
 
 
624 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0580  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  37.19 
 
 
629 aa  412  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1201  hypothetical protein  40.77 
 
 
636 aa  412  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.04112 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0567  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  36.74 
 
 
629 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0848  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  39.52 
 
 
658 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0224  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.82 
 
 
656 aa  406  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000113178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0159  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  38.94 
 
 
668 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0741814  unclonable  0.0000000322464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3047  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  40.06 
 
 
660 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0361  type III restriction-modification system, Mod subunit  39.3 
 
 
683 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000361373  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0543  DNA methylase N-4/N-6  35.18 
 
 
657 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263725  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5227  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  37.12 
 
 
641 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154135  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1148  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  38.34 
 
 
644 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.753419  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0029  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  35.31 
 
 
668 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0020  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  35.17 
 
 
672 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1946  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  36.45 
 
 
631 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2208  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  38.86 
 
 
477 aa  335  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0802  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.08 
 
 
586 aa  310  8e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1743  adenine specific DNA methylase Mod-like  37.95 
 
 
445 aa  290  8e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0524205  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0514  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  59.02 
 
 
664 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0042  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  50 
 
 
672 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0028  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  50 
 
 
672 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.666272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0047  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  49.6 
 
 
668 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3213  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  48.66 
 
 
672 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05370  adenine specific DNA methylase Mod  45.63 
 
 
646 aa  248  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0029  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  48.8 
 
 
688 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2674  type III DNA modification methyltransferase  48.43 
 
 
677 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0259  type III DNA modification methyltransferase  48.43 
 
 
677 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0041  type III DNA modification methyltransferase  48.8 
 
 
682 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0046  type III DNA modification methyltransferase  48.43 
 
 
671 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0046  type III DNA modification methyltransferase  48.43 
 
 
677 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.312444  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3280  type III DNA modification methyltransferase  48.43 
 
 
671 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1847  type III DNA modification methyltransferase  48.43 
 
 
671 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2705  type III DNA modification methyltransferase  48.43 
 
 
671 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1112  type III restriction-modification system, methylase subunit  40.43 
 
 
587 aa  220  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.350936  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0389  type III restriction-modification system StyLTI enzyme mod  32.9 
 
 
652 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  1.57999e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0452  type III restriction-modification system StyLTI enzyme mod  32.71 
 
 
652 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  1.31948e-23 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0397  type III restriction-modification system StyLTI enzyme mod  32.71 
 
 
652 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  1.4274e-23 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0410  type III restriction-modification system StyLTI enzyme mod  32.71 
 
 
652 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640065  decreased coverage  0.0000000770056 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0392  type III restriction-modification system StyLTI enzyme mod  32.71 
 
 
652 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.292703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2249  type III restriction-modification system methylation subunit  51.63 
 
 
227 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1018  type III restriction-modification system enzyme, M subunit  34.1 
 
 
669 aa  211  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3707  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.89 
 
 
392 aa  207  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0529764  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1746  type III restriction system methylase  57.06 
 
 
173 aa  205  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0099  adenine-specific DNA modification methyltransferase  33.26 
 
 
428 aa  202  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.145446  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2247  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.42 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.36 
 
 
1055 aa  196  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1419  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  32.52 
 
 
528 aa  183  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3086  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  32.37 
 
 
571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5299  DNA methylase domain protein  30.26 
 
 
643 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.389542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2779  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.73 
 
 
622 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.787774  normal  0.393495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0972  adenine specific DNA methylase  33.05 
 
 
531 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.223028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2740  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.79 
 
 
609 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00029702  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03955  methyltransferase  30.77 
 
 
543 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4390  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.79 
 
 
531 aa  167  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1004  methyltransferase  30.99 
 
 
526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3323  DNA methylase  30.62 
 
 
542 aa  160  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.622136  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1463  adenine specific DNA methylase Mod-like protein  31.15 
 
 
633 aa  160  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0882  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.97 
 
 
542 aa  157  7e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2240  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.65 
 
 
571 aa  153  8e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.252325  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0851  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.18 
 
 
586 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2276  adenine specific DNA methylase  30.23 
 
 
559 aa  150  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.403052  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3803  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.95 
 
 
566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0826  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.82 
 
 
1050 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.927537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2068  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.57 
 
 
999 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0936  adenine specific DNA methylase MOD  28.68 
 
 
577 aa  133  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000403504  normal  0.65434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0676  DNA methylase N-4/N-6  29.69 
 
 
520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.635951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4169  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.53 
 
 
553 aa  131  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0305  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.97 
 
 
510 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4001  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.19 
 
 
520 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1980  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.25 
 
 
547 aa  127  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52350  adenine specific DNA methylase N-4/N-6  28.31 
 
 
560 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0869  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.41 
 
 
505 aa  124  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0062  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.06 
 
 
1019 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.218127  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1840  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.06 
 
 
1019 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3656  adenine specific DNA methylase Mod  28.27 
 
 
567 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000129355  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0397  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.76 
 
 
1028 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00293449 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1539  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.68 
 
 
1077 aa  118  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.648492 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4096  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.65 
 
 
545 aa  117  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.480555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1085  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.87 
 
 
540 aa  115  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1260  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.3 
 
 
719 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.481233  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0534  DNA methylase  30.1 
 
 
360 aa  111  5e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0447789  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0197  hypothetical protein  27.51 
 
 
646 aa  109  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0731  type III restriction/modification enzyme, methylase subunit  26.22 
 
 
675 aa  106  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.7 
 
 
1073 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4077  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.82 
 
 
635 aa  95.9  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>