More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0214 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  100 
 
 		 419 aa  833    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  60.48 
 
 		 420 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  60.81 
 
 		 424 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  60.43 
 
 		 421 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  58.81 
 
 		 419 aa  481  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  59.52 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  54.89 
 
 		 418 aa  479  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  54.21 
 
 		 435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  55.69 
 
 		 421 aa  462  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  55.16 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  55.48 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  55.92 
 
 		 422 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  51.83 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  50.96 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  48.24 
 
 		 435 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  49.41 
 
 		 435 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  52.02 
 
 		 445 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  49.18 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  52.84 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  52.61 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  51.52 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  48.48 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  48.24 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  48.95 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  51.66 
 
 		 447 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  48.95 
 
 		 435 aa  418  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  49.88 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  50 
 
 		 448 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  53.15 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  48.95 
 
 		 442 aa  411  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  49.42 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  50.12 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  49.65 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  49.88 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  49.65 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  49.88 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  51.51 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  49.42 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  46.62 
 
 		 443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  49.42 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  46.62 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  51.74 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  48.74 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  48.74 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  48.74 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  48.74 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  48.74 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  49.07 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  48.97 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  48.74 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  48.97 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  48.97 
 
 		 433 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2790  preprotein translocase subunit SecY  49.88 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000168645  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  47.04 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  48.68 
 
 		 446 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  48.8 
 
 		 446 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  44.37 
 
 		 435 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  47.09 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  45.86 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  47.32 
 
 		 441 aa  398  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  47.98 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  48.56 
 
 		 446 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  48.21 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  48.11 
 
 		 436 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  48.44 
 
 		 446 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  47.96 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  50.12 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  47.48 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  49.89 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  46.28 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  46.17 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  47.87 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  45.79 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  46.17 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  46.62 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  46.59 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  48.56 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  47.1 
 
 		 441 aa  388  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  46.48 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  47.36 
 
 		 445 aa  388  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0124  preprotein translocase subunit SecY  49.43 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1843  preprotein translocase subunit SecY  48.04 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  47.75 
 
 		 439 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  46.19 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  48.87 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  45.8 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  46.12 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  45.69 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  45.9 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  48.8 
 
 		 446 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  47.49 
 
 		 443 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  46.03 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  45.9 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  48.8 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  48.56 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  48.56 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  48.56 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  46.51 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  45.9 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  48.13 
 
 		 439 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>