234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0212 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0212  LSU ribosomal protein L30P  100 
 
 		 63 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161029  normal  0.28126 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 61 aa  64.3  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  56.9 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  50.82 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 62 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0515  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181031  unclonable  0.0000000000137591 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0345  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  50.82 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  56.9 
 
 		 61 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  50 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0476  50S ribosomal protein L30P  49.15 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  57.41 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  50.82 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  50.88 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0840  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  48.39 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0951  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0200139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3310  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129618 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  44.07 
 
 		 61 aa  52  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  47.54 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  50 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 61 aa  52  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  52  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0451  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0719  ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.545555  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  44.9 
 
 		 51 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2211  50S ribosomal protein L30  44.26 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000289447  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  45.9 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  39.66 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3399  ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34793  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  48.21 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000657277  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  44.83 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0423  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.60192  normal  0.209018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 62 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 60 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2046  50S ribosomal protein L30  40.98 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00780916  normal  0.406407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2306  50S ribosomal protein L30  47.54 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000025708  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  42.11 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0269  ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  44.83 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  45 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1084  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.055199  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0313  ribosomal protein L30  49.18 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00845621  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>