More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0210 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0210  LSU ribosomal protein L18P  100 
 
 		 121 aa  246  7e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0545165  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  65.81 
 
 		 121 aa  161  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  63.87 
 
 		 120 aa  157  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  62.81 
 
 		 120 aa  153  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  61.98 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  60.5 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  61.16 
 
 		 120 aa  150  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  65.18 
 
 		 125 aa  150  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  62.3 
 
 		 121 aa  150  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  58.82 
 
 		 120 aa  149  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  60.17 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  61.54 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 120 aa  148  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 120 aa  147  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 120 aa  147  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 120 aa  147  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 120 aa  147  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 120 aa  147  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 120 aa  147  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 120 aa  147  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 120 aa  147  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  63.25 
 
 		 119 aa  146  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  63.25 
 
 		 119 aa  146  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  59.5 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  57.85 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  58.82 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  55.37 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  57.85 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  61.06 
 
 		 122 aa  143  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  59.5 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  55.93 
 
 		 124 aa  140  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  52.89 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  56.2 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  58.97 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  56.2 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  56.9 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  58.06 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 		 120 aa  137  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  57.26 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  63.37 
 
 		 120 aa  135  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  58.12 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  55.83 
 
 		 121 aa  135  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  61.76 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  64 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  64 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  57.26 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  54.1 
 
 		 122 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  54.1 
 
 		 122 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 114 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  49.58 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  57.26 
 
 		 122 aa  130  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  58.82 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  54.1 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  54.1 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  54.1 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  52.46 
 
 		 122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 		 115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  51.26 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  50.82 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 		 117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  52.46 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  50 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  52.14 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  51.26 
 
 		 116 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  56.9 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  55.86 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  54.7 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0302  50S ribosomal protein L18  59.6 
 
 		 122 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000021695  normal  0.152998 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  52.07 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  54.7 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  55.26 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  55.86 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1731  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 119 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00463126  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0377  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 119 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  51.28 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000432903  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0438  50S ribosomal protein L18  53.72 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560325  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2518  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  52.99 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  50 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  52.59 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1145  ribosomal protein L18  59 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000549459  normal  0.0107289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 127 aa  120  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 		 119 aa  120  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>