More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0200 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  100 
 
 		 229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  67.62 
 
 		 221 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  66.51 
 
 		 218 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  65.55 
 
 		 219 aa  305  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  64.9 
 
 		 219 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  65.12 
 
 		 218 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  65.73 
 
 		 214 aa  298  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  64.29 
 
 		 220 aa  298  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  65.24 
 
 		 226 aa  295  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  61.36 
 
 		 226 aa  295  5e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  64.42 
 
 		 219 aa  293  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  61.43 
 
 		 218 aa  290  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  61.57 
 
 		 222 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  63.33 
 
 		 221 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 221 aa  287  1e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 219 aa  287  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  62.68 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 210 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  61.21 
 
 		 217 aa  283  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  61.61 
 
 		 222 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  62.86 
 
 		 220 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 217 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 217 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  62.02 
 
 		 217 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 211 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 211 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 217 aa  278  4e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 210 aa  278  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  59.33 
 
 		 224 aa  278  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  59.33 
 
 		 224 aa  278  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 		 217 aa  278  4e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  60.39 
 
 		 210 aa  278  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  59.33 
 
 		 224 aa  278  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  56.64 
 
 		 227 aa  278  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  59.42 
 
 		 211 aa  276  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  59.42 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  58.85 
 
 		 262 aa  273  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  58.85 
 
 		 210 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  58.37 
 
 		 224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  57.08 
 
 		 223 aa  271  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  58.37 
 
 		 260 aa  270  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4921  ribosomal protein S3  54.87 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0969238  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  56.16 
 
 		 222 aa  265  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  56.16 
 
 		 222 aa  265  5e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 219 aa  264  8e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  55.46 
 
 		 245 aa  263  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  55.11 
 
 		 237 aa  263  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 228 aa  263  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0333  ribosomal protein S3  59.42 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  58.37 
 
 		 395 aa  263  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  56.52 
 
 		 223 aa  262  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0503  ribosomal protein S3  59.42 
 
 		 220 aa  262  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.216514  hitchhiker  0.000000000339097 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  55.75 
 
 		 226 aa  261  6e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 228 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 228 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  56.25 
 
 		 233 aa  261  8e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0714  ribosomal protein S3  56.87 
 
 		 216 aa  261  8e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874756  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0202  SSU ribosomal protein S3P  58.72 
 
 		 223 aa  261  8.999999999999999e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  53.51 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  53.51 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 228 aa  260  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  55.14 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  58.57 
 
 		 238 aa  259  3e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  57.8 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  55.56 
 
 		 210 aa  258  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 243 aa  258  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 228 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  54.11 
 
 		 236 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 228 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 228 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  54.11 
 
 		 236 aa  258  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  54.11 
 
 		 236 aa  258  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3429  ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 268 aa  257  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  54.91 
 
 		 224 aa  257  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10721  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 274 aa  256  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.680794  normal  0.235718 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  55.7 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  55.26 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  53.74 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 232 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0427  30S ribosomal protein S3  52.63 
 
 		 232 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159032  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 235 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  53.71 
 
 		 231 aa  255  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  56.77 
 
 		 229 aa  255  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>