More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0195 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  100 
 
 		 207 aa  427  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  58.45 
 
 		 206 aa  265  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  57 
 
 		 207 aa  261  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  55.07 
 
 		 207 aa  259  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  57 
 
 		 206 aa  257  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  58.94 
 
 		 207 aa  255  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  54.59 
 
 		 207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  58.94 
 
 		 207 aa  252  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  58.45 
 
 		 206 aa  250  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  57.97 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  57.97 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  57.97 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  57.97 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  57.97 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  57.97 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  57.97 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  57.97 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  57.97 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  57.97 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  56.52 
 
 		 206 aa  242  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  53.14 
 
 		 207 aa  242  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  57 
 
 		 207 aa  242  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  55.56 
 
 		 207 aa  239  1e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  55.07 
 
 		 204 aa  238  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  54.11 
 
 		 204 aa  237  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  55.07 
 
 		 206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  51.44 
 
 		 208 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  51.92 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  52.91 
 
 		 207 aa  228  5e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  52.4 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  49.76 
 
 		 207 aa  225  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  49.03 
 
 		 208 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  47.98 
 
 		 207 aa  204  6e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  45.41 
 
 		 205 aa  201  5e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  48.22 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  48.22 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  48.04 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  48.54 
 
 		 207 aa  199  3e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  46.15 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  47.98 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  43.96 
 
 		 207 aa  191  8e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  46.36 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  43.69 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  43.96 
 
 		 207 aa  189  4e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  43.54 
 
 		 208 aa  187  5.999999999999999e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  47.56 
 
 		 235 aa  187  9e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  47.56 
 
 		 235 aa  187  9e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  44.29 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  44.33 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  45.54 
 
 		 209 aa  185  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  46.31 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  43.06 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  41.75 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  41.18 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  44.34 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  39.81 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  44.95 
 
 		 221 aa  177  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  40.2 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  40.69 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  44.44 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  44.76 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  44.17 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 207 aa  174  6e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  41.23 
 
 		 210 aa  174  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  41.1 
 
 		 221 aa  174  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  41.9 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  42.38 
 
 		 211 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  42.38 
 
 		 211 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  39.41 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0768  50S ribosomal protein L4  41.29 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000241518  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1417  ribosomal protein L4/L1e  39.9 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.977567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  42.23 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  42.38 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  42.34 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  43.84 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  39.71 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2295  50S ribosomal protein L4  43.48 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0333756  hitchhiker  0.00351228 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  40.2 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0427  50S ribosomal protein L4  42.93 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154423  decreased coverage  0.00000614317 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  41.55 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  39.71 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  40.38 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  40.58 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0585  50S ribosomal protein L4  41.45 
 
 		 201 aa  168  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000207865  normal  0.110437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0284  50S ribosomal protein L4  41.45 
 
 		 201 aa  168  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000222015  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3914  50S ribosomal protein L4  41.45 
 
 		 201 aa  168  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.05295e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3802  50S ribosomal protein L4  40.84 
 
 		 201 aa  167  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166287  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3704  50S ribosomal protein L4  40.84 
 
 		 201 aa  167  9e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0394  50S ribosomal protein L4  40.84 
 
 		 201 aa  167  9e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000249214  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3708  50S ribosomal protein L4  40.84 
 
 		 201 aa  167  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  0.838559 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3513  50S ribosomal protein L4  40.84 
 
 		 201 aa  167  9e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109628  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3614  50S ribosomal protein L4  40.84 
 
 		 201 aa  167  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000161283  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>