More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0180 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  100 
 
 
174 aa  348  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  65.52 
 
 
175 aa  249  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  68.39 
 
 
175 aa  248  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  64.94 
 
 
175 aa  243  9e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  65.52 
 
 
175 aa  240  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  66.1 
 
 
177 aa  239  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  58.96 
 
 
175 aa  231  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  59.89 
 
 
178 aa  228  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  56.57 
 
 
203 aa  225  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  58.76 
 
 
181 aa  224  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  65.54 
 
 
177 aa  223  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  62.43 
 
 
176 aa  221  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  57.23 
 
 
187 aa  218  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  59.65 
 
 
188 aa  213  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  56.65 
 
 
194 aa  212  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  56.07 
 
 
194 aa  211  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  58.29 
 
 
182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  58.29 
 
 
182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  57.71 
 
 
182 aa  209  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  58.52 
 
 
176 aa  208  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  57.31 
 
 
201 aa  208  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  62.15 
 
 
177 aa  208  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  62.15 
 
 
177 aa  207  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  62.15 
 
 
177 aa  207  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  59.54 
 
 
172 aa  206  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  62.15 
 
 
177 aa  207  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  62.15 
 
 
177 aa  207  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  62.15 
 
 
177 aa  207  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  62.15 
 
 
177 aa  207  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  62.15 
 
 
177 aa  207  9e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  62.15 
 
 
177 aa  207  9e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  61.58 
 
 
177 aa  205  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  56.14 
 
 
174 aa  205  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  55.62 
 
 
178 aa  204  6e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  57.23 
 
 
177 aa  203  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  53.41 
 
 
181 aa  202  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  54.6 
 
 
180 aa  201  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  52.6 
 
 
177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  52.6 
 
 
177 aa  194  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  52.02 
 
 
177 aa  194  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  56.18 
 
 
178 aa  192  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  49.73 
 
 
266 aa  191  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  53.18 
 
 
183 aa  190  9e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  49.71 
 
 
177 aa  187  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  53.71 
 
 
188 aa  187  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  49.44 
 
 
250 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  50 
 
 
181 aa  185  3e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  49.46 
 
 
306 aa  184  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  47.13 
 
 
180 aa  184  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  50.28 
 
 
177 aa  184  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 
177 aa  183  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  52.57 
 
 
192 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  47.46 
 
 
177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  47.49 
 
 
266 aa  180  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  48 
 
 
175 aa  180  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  48.54 
 
 
173 aa  180  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  49.45 
 
 
185 aa  179  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  49.71 
 
 
273 aa  180  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  49.71 
 
 
277 aa  179  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  48.02 
 
 
243 aa  179  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  45.41 
 
 
272 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  49.14 
 
 
175 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  50 
 
 
199 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  48.55 
 
 
199 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  53.22 
 
 
173 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  53.22 
 
 
173 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  49.43 
 
 
197 aa  179  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  46.07 
 
 
198 aa  179  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000249386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  49.14 
 
 
175 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  47.43 
 
 
175 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  49.43 
 
 
198 aa  178  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  49.13 
 
 
202 aa  178  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  49.45 
 
 
192 aa  178  4e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  47.4 
 
 
196 aa  177  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  47.4 
 
 
196 aa  177  7e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1021  transcription antitermination protein NusG  46.7 
 
 
213 aa  177  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  46.86 
 
 
175 aa  176  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  50.57 
 
 
203 aa  176  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  44.56 
 
 
266 aa  176  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  49.43 
 
 
194 aa  175  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  46.02 
 
 
176 aa  176  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  48.6 
 
 
228 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  46.29 
 
 
175 aa  175  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  45.79 
 
 
238 aa  175  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  45.79 
 
 
272 aa  175  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 
177 aa  174  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  47.09 
 
 
267 aa  174  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  48.3 
 
 
177 aa  174  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  46.02 
 
 
175 aa  174  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  45.3 
 
 
246 aa  174  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  43.98 
 
 
270 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  43.98 
 
 
270 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2259  NusG antitermination factor  45.98 
 
 
212 aa  173  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610472  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  43.98 
 
 
271 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  49.43 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  45.45 
 
 
176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1103  NusG antitermination factor  44.63 
 
 
186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00324857  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  48.55 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  46.11 
 
 
238 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  47.43 
 
 
178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>