More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0177 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  79.75 
 
 
400 aa  679    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  83.5 
 
 
400 aa  707    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  78 
 
 
395 aa  647    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  81.75 
 
 
400 aa  686    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  81.75 
 
 
400 aa  687    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  81.75 
 
 
400 aa  693    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  80.25 
 
 
400 aa  682    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0699  elongation factor Tu  78.25 
 
 
399 aa  634    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  76.25 
 
 
400 aa  637    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0177  elongation factor Tu  100 
 
 
400 aa  817    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000229884  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  81.5 
 
 
400 aa  688    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0192  elongation factor Tu  100 
 
 
400 aa  817    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174926  normal  0.0285704 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  83.5 
 
 
400 aa  707    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  635    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  635    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  78 
 
 
400 aa  663    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  81.91 
 
 
400 aa  693    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  80.5 
 
 
397 aa  650    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  80.5 
 
 
397 aa  650    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  79.75 
 
 
400 aa  671    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  79.75 
 
 
400 aa  671    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  80.9 
 
 
399 aa  680    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  81.16 
 
 
400 aa  681    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0686  elongation factor Tu  77.75 
 
 
399 aa  632  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  76.56 
 
 
396 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  76.56 
 
 
396 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  73.33 
 
 
405 aa  625  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  79.5 
 
 
395 aa  624  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  625  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  625  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  73.33 
 
 
405 aa  625  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  79.75 
 
 
395 aa  623  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  74.75 
 
 
400 aa  622  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  73.5 
 
 
400 aa  618  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  74 
 
 
397 aa  619  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  75.31 
 
 
396 aa  620  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  75.31 
 
 
396 aa  620  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  73.5 
 
 
400 aa  618  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  75.5 
 
 
396 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  75.5 
 
 
396 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  73.75 
 
 
397 aa  617  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  74.06 
 
 
397 aa  614  1e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  74.06 
 
 
397 aa  614  1e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  75.25 
 
 
396 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  74.06 
 
 
397 aa  614  1e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  75.25 
 
 
396 aa  614  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  73 
 
 
399 aa  615  1e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  74.81 
 
 
396 aa  617  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  74.81 
 
 
396 aa  617  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  74.63 
 
 
396 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  75.56 
 
 
396 aa  615  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  75.56 
 
 
396 aa  615  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  75.25 
 
 
396 aa  614  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  74.06 
 
 
397 aa  614  1e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  75.25 
 
 
396 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  75 
 
 
400 aa  614  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  72.75 
 
 
399 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  72.75 
 
 
399 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  72.75 
 
 
399 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2690  translation elongation factor Tu  76.11 
 
 
405 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000740208  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  76.11 
 
 
405 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  75 
 
 
396 aa  611  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  73.75 
 
 
396 aa  611  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  73.75 
 
 
396 aa  611  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  75.87 
 
 
397 aa  612  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  79 
 
 
395 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  74.2 
 
 
396 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  75.87 
 
 
397 aa  612  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  73 
 
 
399 aa  609  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  75 
 
 
396 aa  607  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  610  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  74.94 
 
 
396 aa  607  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  74.56 
 
 
396 aa  610  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  74.31 
 
 
396 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  73.25 
 
 
397 aa  610  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  73.62 
 
 
396 aa  608  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  73.25 
 
 
397 aa  610  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0822  elongation factor Tu  74.5 
 
 
400 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0296542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0835  elongation factor Tu  74.5 
 
 
397 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.010413  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  77.5 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  73.33 
 
 
402 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  72.43 
 
 
399 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  73.99 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08830  elongation factor Tu  74.5 
 
 
397 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0517061  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>