More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0171 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
469 aa  976    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  59.62 
 
 
466 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 
468 aa  546  1e-154  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
468 aa  548  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 
466 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 
465 aa  533  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 
466 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 
466 aa  525  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
465 aa  521  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
465 aa  520  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
465 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
465 aa  519  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
465 aa  519  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 
465 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
465 aa  519  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
465 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 
465 aa  511  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
470 aa  514  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 
466 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 
465 aa  502  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 
465 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
486 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 
466 aa  490  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
478 aa  488  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 
474 aa  487  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 
472 aa  481  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
474 aa  481  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  47 
 
 
485 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
500 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
466 aa  475  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
466 aa  475  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
481 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
493 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
484 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
470 aa  464  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
487 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
493 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
477 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
476 aa  455  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
494 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
479 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
459 aa  451  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
498 aa  451  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
481 aa  450  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
493 aa  450  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
480 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 
447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
499 aa  444  1e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
455 aa  442  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
501 aa  442  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
455 aa  443  1e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
487 aa  440  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
478 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
485 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
478 aa  438  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
485 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
447 aa  436  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
476 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 
456 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
465 aa  434  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
456 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 
460 aa  434  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
476 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
476 aa  433  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
505 aa  432  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
485 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
490 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
463 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
459 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
461 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
460 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
459 aa  429  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
485 aa  430  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 
461 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
468 aa  431  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
460 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
484 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
456 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  44.31 
 
 
485 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
459 aa  428  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
454 aa  425  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
461 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
465 aa  427  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
458 aa  428  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
484 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
462 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
460 aa  423  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
461 aa  424  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
460 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
459 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
461 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
459 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
469 aa  425  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 
464 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
461 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
460 aa  423  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
474 aa  422  1e-117  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>