49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0144 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0144  UvrB/UvrC protein  100 
 
 
175 aa  361  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0081  UvrB/UvrC protein  54.55 
 
 
182 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00231542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0074  UvrB/UvrC protein  51.69 
 
 
182 aa  181  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0833  UvrB/UvrC protein  48.59 
 
 
171 aa  180  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000420974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1827  UvrB/UvrC protein  48.28 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280692  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00850  UvrB/UvrC protein  52.3 
 
 
170 aa  171  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.038021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0079  hypothetical protein  48.02 
 
 
182 aa  170  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0078  hypothetical protein  48.02 
 
 
182 aa  170  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0792443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0089  hypothetical protein  48.02 
 
 
182 aa  170  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84577e-49 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0075  nucleotide excision repair protein  48.02 
 
 
182 aa  170  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452997  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0076  UvrB/UvrC protein  48.02 
 
 
182 aa  170  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.247563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1791  UvrB/UvrC protein  45.4 
 
 
168 aa  169  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0178  UvrB/UvrC protein  49.14 
 
 
170 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0079  hypothetical protein  47.46 
 
 
182 aa  168  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0077  UvrB/UvrC protein  50.57 
 
 
182 aa  168  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0109  hypothetical protein  47.46 
 
 
182 aa  167  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0074  UvrB/UvrC protein  46.89 
 
 
182 aa  167  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5226  hypothetical protein  48.02 
 
 
182 aa  167  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000128201  hitchhiker  4.7433e-20 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2742  UvrB/UvrC protein  45.14 
 
 
173 aa  165  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0160  UvrB/UvrC protein  43.43 
 
 
169 aa  164  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0100  hypothetical protein  47.19 
 
 
182 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0179  UvrB/UvrC protein  43.18 
 
 
167 aa  155  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0253  UvrB/UvrC protein  43.68 
 
 
174 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0325  UvrB/UvrC protein  42.2 
 
 
162 aa  144  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358864  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1950  UvrB/UvrC protein  41.86 
 
 
177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0127215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0387  UvrB/UvrC protein  39.66 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2369  hypothetical protein  40.12 
 
 
169 aa  121  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000515373  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3463  UvrB/UvrC protein  38.92 
 
 
173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000125325  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2676  UvrB/UvrC protein  36.63 
 
 
170 aa  115  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.712915  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0057  UvrB/UvrC protein  38.15 
 
 
178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00323429  normal  0.240627 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0762  UvrB/UvrC protein  33.14 
 
 
173 aa  105  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0331206  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0559  hypothetical protein  30.32 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0545  hypothetical protein  30.32 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1084  Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs-like protein  28.73 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.944063  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0163  UvrB/UvrC domain-containing protein  30.16 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2439  hypothetical protein  30.46 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2753  hypothetical protein  30.59 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1404  UvrB/UvrC protein  30.99 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2038  UVR domain-containing protein  24.71 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1482  UvrB/UvrC protein  25.29 
 
 
145 aa  57.8  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.051637  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0125  uncharacterized protein with conserved CXXC pairs  24.23 
 
 
193 aa  55.5  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.587234  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0047  hypothetical protein  23.37 
 
 
177 aa  47.8  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0283317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0889  ATPase AAA-2 domain protein  38.33 
 
 
725 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000179007  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1363  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  40 
 
 
722 aa  42.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000152049 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1327  ATPase  21.59 
 
 
734 aa  41.6  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00363395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3262  excinuclease ABC subunit B  47.22 
 
 
664 aa  41.6  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0845  excinuclease ABC, B subunit  50 
 
 
675 aa  41.2  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0971  excinuclease ABC, B subunit  50 
 
 
675 aa  41.2  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.91414  normal  0.150476 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2184  excinuclease ABC subunit B  34.21 
 
 
698 aa  41.2  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.383397  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>