More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0116 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
164 aa  318  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  69.28 
 
 
158 aa  216  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  69.28 
 
 
158 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  69.93 
 
 
156 aa  207  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  65.36 
 
 
159 aa  202  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  69.93 
 
 
158 aa  202  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  61.69 
 
 
163 aa  197  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  63.46 
 
 
158 aa  197  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  62.09 
 
 
160 aa  195  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  64.05 
 
 
157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  58.17 
 
 
158 aa  187  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  58.17 
 
 
158 aa  187  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  61.84 
 
 
161 aa  187  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  59.48 
 
 
159 aa  181  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  62.75 
 
 
159 aa  174  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  58 
 
 
162 aa  169  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  54.36 
 
 
158 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 
159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  53.59 
 
 
175 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  53.59 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  53.02 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  53.02 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  53.02 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  53.02 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  52.29 
 
 
175 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  53.02 
 
 
158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  53.02 
 
 
158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  52.35 
 
 
175 aa  160  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 
158 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  55.56 
 
 
157 aa  157  7e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  53.47 
 
 
161 aa  154  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  51.01 
 
 
160 aa  148  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  50.67 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  50 
 
 
160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 
157 aa  143  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  50.33 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  47.74 
 
 
157 aa  137  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 
155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  50 
 
 
156 aa  134  8e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 
156 aa  134  8e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 
156 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  56.85 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  56.85 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  45 
 
 
164 aa  130  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  56.16 
 
 
158 aa  130  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 
162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  49.35 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  49.01 
 
 
158 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 
160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  51.77 
 
 
156 aa  127  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  47.02 
 
 
158 aa  127  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 
156 aa  125  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 
158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  48.85 
 
 
160 aa  124  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  48.1 
 
 
158 aa  124  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 
158 aa  123  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 
161 aa  123  9e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 
157 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 
160 aa  123  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  44.38 
 
 
172 aa  120  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 
159 aa  121  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 
159 aa  120  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 
158 aa  120  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 
159 aa  120  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 
156 aa  120  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 
158 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  49.65 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  45.75 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 
158 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 
158 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 
158 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 
160 aa  119  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 
158 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  43.14 
 
 
158 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 
159 aa  118  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 
158 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 
158 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 
158 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  46.81 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  45.1 
 
 
173 aa  117  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 
158 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 
158 aa  117  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 
159 aa  117  7e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 
158 aa  117  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 
158 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 
159 aa  117  9e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 
158 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>