25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0114 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0114  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  620  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0358289  hitchhiker  0.00078389 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00720  hypothetical protein  53.18 
 
 
305 aa  329  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000877673  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0807  hypothetical protein  53.47 
 
 
302 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00370253  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0149  hypothetical protein  54.13 
 
 
300 aa  323  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0567257  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0475  hypothetical protein  49.5 
 
 
299 aa  308  6.999999999999999e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2695  hypothetical protein  50 
 
 
317 aa  305  7e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3630  dehydrogenase-like protein  50.17 
 
 
312 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal  0.352042 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1511  hypothetical protein  48.5 
 
 
301 aa  292  6e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.850305  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0112  hypothetical protein  46.03 
 
 
304 aa  290  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000282861  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2025  hypothetical protein  47.02 
 
 
299 aa  286  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0375526  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0492  hypothetical protein  46.69 
 
 
334 aa  287  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0587  hypothetical protein  46.82 
 
 
303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0873705  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1830  hypothetical protein  47.52 
 
 
304 aa  282  5.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.290615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.52 
 
 
685 aa  199  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.52 
 
 
685 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 
681 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.1 
 
 
691 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  28.48 
 
 
728 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  28.8 
 
 
728 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  28 
 
 
707 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  26.67 
 
 
720 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  26.67 
 
 
707 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  26.62 
 
 
684 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  26 
 
 
710 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  20.13 
 
 
689 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>