More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0100 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.87 
 
 
959 aa  708  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.82 
 
 
674 aa  746  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.42 
 
 
1410 aa  758  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.8 
 
 
984 aa  732  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.8 
 
 
984 aa  729  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.69 
 
 
984 aa  731  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.99 
 
 
1425 aa  738  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.6 
 
 
687 aa  703  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.02 
 
 
688 aa  702  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.63 
 
 
676 aa  705  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0627  molybdopterin oxidoreductase family protein  38.14 
 
 
978 aa  644  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0716  molybdopterin oxidoreductase family protein  37.93 
 
 
978 aa  641  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.52 
 
 
973 aa  649  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.55 
 
 
944 aa  734  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.99 
 
 
1424 aa  739  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2853  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.2 
 
 
960 aa  682  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.771386 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.5 
 
 
1425 aa  733  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.99 
 
 
963 aa  644  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3656  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.75 
 
 
948 aa  712  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.480327 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.51 
 
 
688 aa  693  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.67 
 
 
688 aa  710  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2741  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.63 
 
 
960 aa  689  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.313061 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.15 
 
 
893 aa  1043  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.72 
 
 
1432 aa  743  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.23 
 
 
905 aa  844  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.74 
 
 
689 aa  683  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.78 
 
 
686 aa  692  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.21 
 
 
988 aa  639  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.62 
 
 
920 aa  833  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.02 
 
 
983 aa  730  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.57 
 
 
904 aa  978  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2856  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.48 
 
 
959 aa  701  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  49.71 
 
 
689 aa  687  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.8 
 
 
984 aa  732  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  40.39 
 
 
977 aa  717  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.72 
 
 
950 aa  725  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.53 
 
 
959 aa  717  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.8 
 
 
984 aa  732  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4710  molybdopterin oxidoreductase family protein  38.14 
 
 
978 aa  643  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0645  molybdopterin oxidoreductase family protein  38.03 
 
 
978 aa  642  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.293395 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3660  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.08 
 
 
888 aa  667  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  45.82 
 
 
1385 aa  712  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4998  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.74 
 
 
953 aa  710  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217845  hitchhiker  0.000835215 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.82 
 
 
674 aa  744  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.07 
 
 
676 aa  705  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.14 
 
 
988 aa  642  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.22 
 
 
969 aa  716  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.02 
 
 
983 aa  731  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.31 
 
 
933 aa  680  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.19 
 
 
951 aa  714  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  46 
 
 
1440 aa  756  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.5 
 
 
1421 aa  746  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.59 
 
 
978 aa  711  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.66 
 
 
959 aa  727  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.62 
 
 
1426 aa  716  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.13 
 
 
983 aa  731  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.44 
 
 
960 aa  732  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0502  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.42 
 
 
980 aa  642  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4406  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.5 
 
 
950 aa  722  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.64 
 
 
983 aa  739  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.19 
 
 
917 aa  1010  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.69 
 
 
979 aa  746  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.16 
 
 
1440 aa  738  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4642  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.1 
 
 
886 aa  638  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0800652  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.22 
 
 
959 aa  702  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.39 
 
 
677 aa  759  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.77 
 
 
674 aa  742  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.03 
 
 
1000 aa  752  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.55 
 
 
960 aa  734  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1473  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.33 
 
 
947 aa  721  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0442327  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.49 
 
 
948 aa  716  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3089  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.13 
 
 
959 aa  725  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440267  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.97 
 
 
674 aa  742  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.48 
 
 
676 aa  700  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.86 
 
 
982 aa  743  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  45.3 
 
 
1412 aa  701  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 
893 aa  1853  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.02152e-05  hitchhiker  2.06048e-13 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.35 
 
 
946 aa  717  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.39 
 
 
900 aa  943  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0505  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.89 
 
 
980 aa  642  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.74 
 
 
1425 aa  731  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.29 
 
 
950 aa  719  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.75 
 
 
946 aa  727  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.61 
 
 
879 aa  830  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1080  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  39.63 
 
 
960 aa  689  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.91 
 
 
983 aa  730  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.24 
 
 
893 aa  1033  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.08 
 
 
900 aa  1011  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0589  molybdopterin oxidoreductase family protein  38.03 
 
 
978 aa  642  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.75 
 
 
956 aa  714  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  52.21 
 
 
745 aa  729  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  53.34 
 
 
899 aa  985  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.91 
 
 
984 aa  730  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.12 
 
 
994 aa  659  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.66 
 
 
903 aa  777  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.58 
 
 
948 aa  711  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.75 
 
 
952 aa  714  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.14 
 
 
886 aa  872  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.11 
 
 
686 aa  674  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.93 
 
 
685 aa  644  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>