More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0090 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0090  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  100 
 
 
541 aa  1104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00173924  hitchhiker  0.00306857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0663  putative PAS/PAC sensor protein  48.05 
 
 
527 aa  521  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2640  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  43.55 
 
 
532 aa  424  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1326  putative sigma54 specific transcriptional regulator  44.9 
 
 
540 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.01296e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2382  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.82 
 
 
539 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0222564  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1486  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.42 
 
 
525 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0842644  hitchhiker  1.47012e-08 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1552  Fis family transcriptional regulator  39.29 
 
 
525 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.246478  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2153  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.35 
 
 
604 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1348  putative PAS/PAC sensor protein  35.75 
 
 
506 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0996  putative PAS/PAC sensor protein  35.27 
 
 
502 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4227  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  35.46 
 
 
531 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0941591  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1034  transcriptional regulator, TyrR  35.08 
 
 
502 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0997  sigma-54 dependent transcriptional regulator/sensory box protein  35.08 
 
 
502 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25940  sigma54-dependent activator protein  35.25 
 
 
505 aa  327  2e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.935166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1699  acetoin operon expression regulatory protein  40.16 
 
 
671 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.263456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1794  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  36.11 
 
 
525 aa  323  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1902  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  36.11 
 
 
525 aa  323  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2529  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  36.11 
 
 
525 aa  323  7e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1931  transcriptional regulator  38.87 
 
 
935 aa  318  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0885  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  40.44 
 
 
661 aa  317  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0287148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3111  transcriptional regulator, TyrR  33.93 
 
 
517 aa  316  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.605009 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06720  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.92 
 
 
581 aa  313  4e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2835  putative PAS/PAC sensor protein  37.42 
 
 
591 aa  313  4e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.81177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1763  putative PAS/PAC sensor protein  38.94 
 
 
698 aa  313  6e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4390  transcriptional regulator TyrR  33.96 
 
 
502 aa  313  7e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3598  proprionate catabolism activator, Fis family  39.24 
 
 
639 aa  312  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.00055082  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3994  transcriptional regulator, TyrR  33.51 
 
 
519 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.295924  normal  0.0800973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32940  transcriptional regulator  34.99 
 
 
511 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.86487e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3778  transcriptional regulator, TyrR  33.63 
 
 
519 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18738  hitchhiker  0.000851143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2801  transcriptional regulator  34.81 
 
 
511 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1500  transcriptional regulator TyrR  33.15 
 
 
520 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2617  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  34.43 
 
 
523 aa  309  7e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.881496 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0399  putative PAS/PAC sensor protein  37.47 
 
 
695 aa  308  1e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1425  transcriptional regulator, TyrR  33.51 
 
 
519 aa  308  1e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.392472  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4489  transcriptional regulator TyrR  33.51 
 
 
519 aa  309  1e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0303  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.12 
 
 
576 aa  307  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.535404 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1024  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.47 
 
 
544 aa  306  4e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  7.01357e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52980  transcriptional regulator PhhR  33.27 
 
 
519 aa  306  5e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1487  sigma-L-dependent transcriptional regulator  36.77 
 
 
696 aa  305  9e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2683  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.61 
 
 
566 aa  305  1e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4643  transcriptional regulator PhhR  33.76 
 
 
515 aa  304  3e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.48 
 
 
636 aa  304  3e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0512499  normal  0.510149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1101  helix-turn-helix, Fis-type  34.33 
 
 
502 aa  303  4e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0456  hypothetical protein  39.92 
 
 
586 aa  303  5e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  38.22 
 
 
710 aa  303  6e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2998  transcriptional regulator, TyrR  34.92 
 
 
518 aa  302  8e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.014514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2324  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  35.03 
 
 
522 aa  302  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1164  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.31 
 
 
501 aa  302  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.245431  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4639  putative sigma54 specific transcriptional regulator  36.31 
 
 
574 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1280  transcriptional regulator TyrR, putative  34.75 
 
 
502 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1911  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.69 
 
 
577 aa  301  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2305  putative sigma54 specific transcriptional regulator  40.17 
 
 
601 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3934  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.18 
 
 
501 aa  300  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534742  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1706  sigma-54 dependent transcriptional regulator  32.85 
 
 
532 aa  300  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1729  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  33.89 
 
 
522 aa  299  7e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2866  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.72 
 
 
703 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3097  putative PAS/PAC sensor protein  34.71 
 
 
510 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2250  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.99 
 
 
571 aa  296  5e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.28606  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1492  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.53 
 
 
569 aa  296  7e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0074  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.21 
 
 
631 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384971  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0792  hypothetical protein  38.93 
 
 
662 aa  294  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3910  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.26 
 
 
690 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4389  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.26 
 
 
690 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4072  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.26 
 
 
690 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3919  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.26 
 
 
690 aa  294  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.346796  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2741  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.08 
 
 
471 aa  294  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4187  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.26 
 
 
690 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.32878e-11 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0260  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.84 
 
 
687 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2667  sigma-54 dependent transcriptional regulator/sensory box protein  37.1 
 
 
668 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2756  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.75 
 
 
462 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02829  Transcriptional regulatory protein tyrR  33.33 
 
 
518 aa  293  6e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0448077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2353  phosphocarrier HPr/sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  37.01 
 
 
668 aa  293  6e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1776  putative PAS/PAC sensor protein  36.77 
 
 
698 aa  293  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4297  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.04 
 
 
690 aa  292  9e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1683  transcriptional regulator  41.25 
 
 
588 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0451023  normal  0.0113335 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2162  putative sigma54 specific transcriptional regulator  47.21 
 
 
558 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000345974 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4239  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.04 
 
 
690 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931391  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0447  putative sigma54 specific transcriptional regulator  42.67 
 
 
438 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2600  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.79 
 
 
585 aa  290  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0957  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.04 
 
 
690 aa  291  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4008  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  40.25 
 
 
690 aa  290  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4277  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.04 
 
 
704 aa  290  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2310  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.48 
 
 
688 aa  289  9e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1201  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.11 
 
 
471 aa  288  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2861  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.9 
 
 
690 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1275  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  42.49 
 
 
709 aa  289  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2604  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  34.12 
 
 
522 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1761  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  32.06 
 
 
536 aa  288  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1588  putative PAS/PAC sensor protein  37.32 
 
 
633 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00103997  normal  0.3831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3574  helix-turn-helix, Fis-type  31.21 
 
 
525 aa  287  3e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1889  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.59 
 
 
752 aa  288  3e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.92 
 
 
459 aa  287  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.60791e-13  unclonable  4.10956e-23 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0286  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.58 
 
 
488 aa  286  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.525369 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2361  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.69 
 
 
450 aa  286  5e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1926  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.48 
 
 
575 aa  286  6e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1388  transcriptional regulator, TyrR  34.06 
 
 
512 aa  286  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2445  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.48 
 
 
553 aa  285  1e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.210628  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1437  transcriptional regulator, TyrR  32.91 
 
 
514 aa  285  1e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.555586  normal  0.67019 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1719  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.02 
 
 
582 aa  285  1e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31410  sigma54-dependent activator protein  39.08 
 
 
667 aa  285  2e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>