More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0085 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0085  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  100 
 
 
323 aa  652  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00153974  normal  0.0550519 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2585  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.43 
 
 
338 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  6.43253e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0244  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.65 
 
 
329 aa  212  6e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1463  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.85 
 
 
326 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1261  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.18 
 
 
326 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1704  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  34.64 
 
 
326 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0104372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1560  bifunctional biotin operon repressor/biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] synthetase  34.31 
 
 
326 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1631  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  34.31 
 
 
326 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.104533 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1447  birA bifunctional protein  34.31 
 
 
326 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.867427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1419  biotin operon repressor  34.31 
 
 
326 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1648  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.51 
 
 
326 aa  203  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1593  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  34.64 
 
 
326 aa  202  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3752  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  34.53 
 
 
326 aa  201  1e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1666  birA bifunctional protein  34.31 
 
 
326 aa  201  1e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1420  biotin operon repressor  33.99 
 
 
326 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1789  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.21 
 
 
326 aa  195  8e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0500  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.49 
 
 
329 aa  195  8e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0134  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.24 
 
 
326 aa  195  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00373648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1479  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.02 
 
 
329 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0876973  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00660  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  37.03 
 
 
326 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1935  birA biofunctional protein, putative  37.7 
 
 
323 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.976784  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1015  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.87 
 
 
326 aa  194  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.207907  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2817  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.86 
 
 
336 aa  192  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.10207e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1058  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.61 
 
 
326 aa  192  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.101759  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1476  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.49 
 
 
330 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2388  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.82 
 
 
330 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0131534  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1571  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.49 
 
 
330 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.929422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2427  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.14 
 
 
321 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1468  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.23 
 
 
329 aa  186  6e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0168  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.8 
 
 
333 aa  185  1e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0654  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.69 
 
 
324 aa  185  1e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0984  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.63 
 
 
335 aa  184  2e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.381797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1987  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.58 
 
 
338 aa  184  2e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.417612  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0125  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.8 
 
 
325 aa  184  2e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  2.98422e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2119  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.5 
 
 
329 aa  184  2e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2576  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.84 
 
 
310 aa  183  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0159  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.36 
 
 
326 aa  183  4e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.41219e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1971  biotin-(acetyl-CoA carboxylase) holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  35.41 
 
 
327 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1653  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.87 
 
 
333 aa  180  3e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0793  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.12 
 
 
336 aa  180  3e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1588  biotin--(acetyl-COA-carboxylase) synthetase  35.67 
 
 
326 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0131  hypothetical protein  33.22 
 
 
328 aa  176  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2840  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.71 
 
 
328 aa  176  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2669  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.59 
 
 
312 aa  175  1e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2191  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.7 
 
 
327 aa  173  4e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0775  transcriptional repressor of the biotin operon / biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase; RBL03563  31.89 
 
 
325 aa  172  6e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  7.28901e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1317  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.54 
 
 
328 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1081  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.12 
 
 
315 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.560256  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0077  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.07 
 
 
327 aa  170  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3184  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.86 
 
 
326 aa  170  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2431  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.86 
 
 
330 aa  169  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552331  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0788  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.2 
 
 
318 aa  169  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2459  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.97 
 
 
329 aa  169  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.472126  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2320  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.26 
 
 
327 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0571544  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2610  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.38 
 
 
335 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.808481 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1903  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.57 
 
 
327 aa  165  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.37759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1000  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.44 
 
 
332 aa  165  1e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0086  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.67 
 
 
332 aa  164  2e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1871  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.9 
 
 
332 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  3.12804e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1136  biotin--protein ligase  32.29 
 
 
312 aa  159  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0797073  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2071  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.99 
 
 
326 aa  159  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3720  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.06 
 
 
344 aa  159  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.071565  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0143  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.41 
 
 
282 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.765173 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2654  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.42 
 
 
343 aa  156  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  35.33 
 
 
312 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  6.64696e-05 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1488  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.16 
 
 
322 aa  155  9e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.11548  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1476  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.59 
 
 
338 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.841583  normal  0.140483 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0111  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.97 
 
 
328 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.71 
 
 
328 aa  149  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0610  birA bifunctional protein  31.65 
 
 
319 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  30.5 
 
 
319 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0209  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.62 
 
 
314 aa  148  1e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0830  biotin--protein ligase  32.9 
 
 
311 aa  147  2e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.676467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4564  biotin--protein ligase  31.33 
 
 
335 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  30.28 
 
 
319 aa  146  4e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0822  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  33.86 
 
 
333 aa  145  7e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  32.38 
 
 
317 aa  145  7e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  30.28 
 
 
319 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  32.29 
 
 
319 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0847  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  34.08 
 
 
331 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1026  birA bifunctional protein  29.64 
 
 
323 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.812765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  32.29 
 
 
319 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.28488e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0663  BirA bifunctional protein  30.86 
 
 
328 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0814484  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1544  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.77 
 
 
323 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00491525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0664  BirA bifunctional protein  30.86 
 
 
328 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.06678  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1515  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.77 
 
 
323 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.567415  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  31.53 
 
 
319 aa  143  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  31.66 
 
 
319 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2081  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.25 
 
 
325 aa  142  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2779  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.77 
 
 
325 aa  142  1e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0162859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  31.11 
 
 
320 aa  142  1e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.34608e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  30.72 
 
 
320 aa  141  1e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0691  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.94 
 
 
330 aa  140  2e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  31.97 
 
 
319 aa  141  2e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  31.13 
 
 
319 aa  141  2e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  31.96 
 
 
320 aa  140  2e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  30.79 
 
 
323 aa  140  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  31.11 
 
 
319 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  29.81 
 
 
321 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  31.61 
 
 
328 aa  140  4e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>