More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0075 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0075  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 
120 aa  237  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  5.91466e-13  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  56.25 
 
 
128 aa  137  4e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.17569e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0122  RNA-binding S1 domain-containing protein  56 
 
 
126 aa  136  9e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0092  RNA binding S1  54.26 
 
 
130 aa  134  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.04617e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00520  RNA binding S1 domain protein  59.17 
 
 
124 aa  134  6e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.85433e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  51.16 
 
 
140 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  9.83919e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  48.55 
 
 
140 aa  120  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.44376e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3080  RNA binding S1 domain protein  48.89 
 
 
144 aa  119  1e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.20475e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0089  RNA binding S1  45.71 
 
 
152 aa  118  2e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0653  RNA binding S1 domain protein  53.78 
 
 
120 aa  117  5e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.31287e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0225  RNA binding S1 domain protein  51.67 
 
 
134 aa  110  8e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  5.84856e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2483  hypothetical protein  47.73 
 
 
134 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.79369e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2797  hypothetical protein  47.73 
 
 
134 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  9.39181e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  42.66 
 
 
152 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  1.48596e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  47.15 
 
 
132 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.38948e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  47.15 
 
 
132 aa  100  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  40.4 
 
 
160 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  7.9318e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  40.4 
 
 
160 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  1.19651e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  40.4 
 
 
160 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  40.4 
 
 
160 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.01317e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  40.13 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.57952e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  40.4 
 
 
160 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.37683e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  40.4 
 
 
160 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  40.13 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.41067e-10  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  40.4 
 
 
160 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  5.44172e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  40.13 
 
 
161 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.17621e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0191  RNA binding S1 domain protein  43.44 
 
 
134 aa  97.8  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  41.67 
 
 
133 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  4.17558e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  41.67 
 
 
133 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  1.00816e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0146  hypothetical protein  41.67 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0265  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.26 
 
 
164 aa  78.6  3e-14  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  41.35 
 
 
129 aa  73.2  1e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0541  general stress protein 13  52.11 
 
 
126 aa  72  2e-12  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0955  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.32 
 
 
125 aa  72.8  2e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0974  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.32 
 
 
125 aa  72.8  2e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  38.28 
 
 
127 aa  72  3e-12  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0981  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.68 
 
 
124 aa  69.7  1e-11  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  4.45297e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1149  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.68 
 
 
124 aa  68.9  2e-11  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  8.79414e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0265  RNA binding S1 domain-containing protein  42.31 
 
 
125 aa  68.9  2e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.383538  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1301  RNA binding S1 domain protein  34.96 
 
 
140 aa  68.2  3e-11  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.52887e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1995  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.53 
 
 
815 aa  68.2  4e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1805  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.75 
 
 
123 aa  67.4  6e-11  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  1.94904e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0600  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  48.53 
 
 
746 aa  66.6  1e-10  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0317346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  32.77 
 
 
124 aa  65.9  2e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1762  RNA binding S1 domain protein  45.68 
 
 
785 aa  65.5  2e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432806  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  39.6 
 
 
773 aa  65.5  2e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  39.42 
 
 
114 aa  65.1  3e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  39.42 
 
 
114 aa  65.1  3e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.7 
 
 
707 aa  65.1  3e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  39.42 
 
 
114 aa  64.7  4e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  39.42 
 
 
114 aa  64.3  5e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  39.42 
 
 
114 aa  64.3  5e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  42.47 
 
 
778 aa  64.3  5e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2102  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  47.62 
 
 
676 aa  64.3  5e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.573374 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1166  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.67 
 
 
123 aa  63.9  7e-10  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  3.91852e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  46.43 
 
 
765 aa  63.5  8e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  50.68 
 
 
114 aa  63.9  8e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  50.68 
 
 
114 aa  63.9  8e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  50.68 
 
 
114 aa  63.9  8e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  50.68 
 
 
114 aa  63.9  8e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  50.68 
 
 
114 aa  63.9  8e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  47.5 
 
 
705 aa  63.9  8e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  38.61 
 
 
766 aa  63.5  9e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  42.47 
 
 
772 aa  62.8  1e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4015  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.84 
 
 
803 aa  62.8  1e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  46.05 
 
 
529 aa  62.8  1e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1292  SSU ribosomal protein S1P  38.83 
 
 
396 aa  62.8  1e-09  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00025498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  44.44 
 
 
382 aa  63.2  1e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  7.30459e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1146  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  52.11 
 
 
722 aa  63.2  1e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119982  normal  0.231253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  44.16 
 
 
608 aa  62.4  2e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  43.84 
 
 
773 aa  62.8  2e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68710  hypothetical protein  43.84 
 
 
779 aa  62  2e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329631  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  43.84 
 
 
779 aa  62.4  2e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0726  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.59 
 
 
796 aa  62.4  2e-09  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  41.98 
 
 
772 aa  62  2e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  40.82 
 
 
268 aa  62  2e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1193  RNA binding S1 domain protein  42.5 
 
 
500 aa  62.4  2e-09  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  6.67111e-06  hitchhiker  0.00401101 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1012  tex protein, putative  43.06 
 
 
817 aa  62.8  2e-09  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  43.84 
 
 
705 aa  62.4  2e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0380  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  37.65 
 
 
703 aa  62.4  2e-09  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  3.45435e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3791  30S ribosomal protein S1  43.82 
 
 
382 aa  62  3e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  7.84339e-08  hitchhiker  0.000188764 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1421  30S ribosomal protein S1  43.82 
 
 
382 aa  62  3e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00177938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1553  30S ribosomal protein S1  43.82 
 
 
382 aa  62  3e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00270143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.84 
 
 
774 aa  61.6  3e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.84 
 
 
774 aa  62  3e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  37.5 
 
 
133 aa  62  3e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  43.84 
 
 
861 aa  61.6  3e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0428  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.48 
 
 
721 aa  62  3e-09  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  3.39931e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3847  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  50 
 
 
711 aa  61.6  4e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147568  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0338  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.06 
 
 
796 aa  61.2  4e-09  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0332916  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.47 
 
 
774 aa  61.2  4e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.47 
 
 
774 aa  61.2  4e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  43.21 
 
 
767 aa  61.6  4e-09  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  41.98 
 
 
121 aa  61.6  4e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.58 
 
 
774 aa  61.6  4e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.53 
 
 
787 aa  61.2  4e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1625  30S ribosomal protein S1  42.7 
 
 
382 aa  61.6  4e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.50504e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1021  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.73 
 
 
707 aa  60.8  5e-09  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.974178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1408  30S ribosomal protein S1  43.82 
 
 
382 aa  60.8  5e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.02607e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2039  RNA binding S1 domain protein  43.84 
 
 
795 aa  61.2  5e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.883528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>