95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0064 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  100 
 
 
518 aa  1021  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  8.77421e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  54.04 
 
 
512 aa  522  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  52.51 
 
 
516 aa  495  1e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1944  AbgT putative transporter  48.05 
 
 
519 aa  460  1e-128  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432903  decreased coverage  0.00626673 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  45.67 
 
 
511 aa  458  1e-128  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  46.23 
 
 
537 aa  447  1e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0739  putative ion transporter  46.94 
 
 
519 aa  439  1e-122  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0389  hypothetical protein  44.85 
 
 
519 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  47.06 
 
 
538 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3833  AbgT putative transporter  45.97 
 
 
535 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4042  AbgT putative transporter  46.34 
 
 
535 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  48.13 
 
 
518 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3926  AbgT putative transporter  46.15 
 
 
535 aa  435  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  44.61 
 
 
535 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4247  AbgT putative transporter  45.91 
 
 
540 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4208  AbgT putative transporter  46.4 
 
 
540 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002729  multidrug efflux pump component MtrF  46.5 
 
 
528 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.189489  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01141  hypothetical protein  45.05 
 
 
519 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  45.9 
 
 
520 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4381  AbgT putative transporter  46.21 
 
 
540 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  46.84 
 
 
538 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4058  AbgT putative transporter  46.04 
 
 
539 aa  428  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000746135  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004283  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  44.66 
 
 
519 aa  428  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  46.21 
 
 
530 aa  427  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  44.55 
 
 
539 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  45.75 
 
 
534 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03248  hypothetical protein  47.51 
 
 
522 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0160  transporter, putative  45.44 
 
 
519 aa  418  1e-115  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  45.37 
 
 
534 aa  416  1e-115  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  46.05 
 
 
512 aa  417  1e-115  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  44.31 
 
 
515 aa  416  1e-115  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0146  AbgT putative transporter  45.83 
 
 
519 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0147  AbgT putative transporter  45.44 
 
 
519 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  44.47 
 
 
519 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  1.27247e-05  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0146  AbgT putative transporter  45.63 
 
 
519 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0094  AbgT putative transporter  46.46 
 
 
511 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0151  AbgT putative transporter  45.63 
 
 
519 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  43.86 
 
 
532 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  45.61 
 
 
525 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  44.44 
 
 
529 aa  395  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  38.01 
 
 
512 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  38.01 
 
 
512 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0029  AbgT putative transporter  41.05 
 
 
506 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  35.71 
 
 
508 aa  365  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  35.71 
 
 
508 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  35.71 
 
 
508 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  35.71 
 
 
508 aa  365  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  35.71 
 
 
510 aa  365  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  35.71 
 
 
508 aa  365  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  35.71 
 
 
508 aa  365  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  35.71 
 
 
510 aa  365  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.328307 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0167  AbgT putative transporter  36.33 
 
 
520 aa  358  1e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.583779  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  37.92 
 
 
514 aa  354  3e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  38.4 
 
 
523 aa  348  2e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  35.51 
 
 
507 aa  348  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  36.25 
 
 
505 aa  345  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4202  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  34.83 
 
 
508 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.609868  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  38.46 
 
 
585 aa  343  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0800  putative efflux pump component MtrF  35.64 
 
 
509 aa  318  2e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0678  AbgT family protein  35.7 
 
 
518 aa  315  2e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0748  AbgT putative transporter  35.7 
 
 
518 aa  315  2e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2611  AbgT putative transporter  36.69 
 
 
552 aa  282  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1579  aminobenzoyl-glutamate transport protein  34.69 
 
 
305 aa  199  1e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  37.69 
 
 
263 aa  173  7e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3467  hypothetical protein  35.23 
 
 
240 aa  50.4  7e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0456304 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  42.37 
 
 
462 aa  50.1  9e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.534367 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1855  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter-like protein  39.34 
 
 
88 aa  50.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2108  short chain fatty acid transporter  38.27 
 
 
448 aa  49.3  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.289141  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01176  hypothetical Short chain fatty acid transporter  41.27 
 
 
435 aa  48.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.680659  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1143  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.45 
 
 
484 aa  48.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.171784  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1419  short chain fatty acid transporter  41.82 
 
 
434 aa  48.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.989346 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3308  hypothetical protein  41.94 
 
 
448 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3329  hypothetical protein  41.94 
 
 
448 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3033  short chain fatty acid transporter  41.94 
 
 
448 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3097  short-chain fatty acids transporter  41.94 
 
 
448 aa  47.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3110  hypothetical protein  41.94 
 
 
448 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3315  hypothetical protein  41.94 
 
 
448 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3000  short-chain fatty acids transporter  41.94 
 
 
448 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3328  hypothetical protein  41.94 
 
 
448 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3356  hypothetical protein  41.94 
 
 
448 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1445  short chain fatty acid transporter  41.27 
 
 
435 aa  47  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2249  short chain fatty acid transporter  41.51 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  25.14 
 
 
485 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1201  short chain fatty acid transporter  37.14 
 
 
447 aa  44.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3052  short chain fatty acid transporter  40.32 
 
 
457 aa  44.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1708  short chain fatty acid transporter  39.62 
 
 
446 aa  44.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2938  short chain fatty acid transporter  39.68 
 
 
436 aa  44.3  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3234  short chain fatty acid transporter  37.14 
 
 
451 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3091  short chain fatty acid transporter  37.14 
 
 
451 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3081  short chain fatty acid transporter  37.14 
 
 
451 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.45839  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2886  short chain fatty acid transporter  37.14 
 
 
442 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2803  short chain fatty acid transporter  37.14 
 
 
442 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1286  short chain fatty acid transporter  37.14 
 
 
451 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.567744 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2982  short chain fatty acid transporter  37.14 
 
 
442 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1391  Short-chain fatty acid transporter  37.14 
 
 
443 aa  43.5  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>