55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0050 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0050  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
507 aa  1016  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  23.35 
 
 
530 aa  58.5  3e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 
590 aa  54.7  3e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  1.65223e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2827  Peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 
130 aa  52.8  1e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.97997e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.73 
 
 
327 aa  52  2e-05  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  42.55 
 
 
284 aa  52  3e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  51.11 
 
 
250 aa  51.2  4e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1285  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  46.81 
 
 
376 aa  50.4  8e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  47.73 
 
 
430 aa  50.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  44.68 
 
 
335 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  40.43 
 
 
292 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  41.3 
 
 
175 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  40.43 
 
 
294 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  40 
 
 
432 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  40.43 
 
 
291 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  28.26 
 
 
520 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 
307 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  3.33433e-07 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0876  stage VI sporulation protein D  42.86 
 
 
351 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  39.58 
 
 
674 aa  47.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  41.46 
 
 
264 aa  47  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  40.91 
 
 
274 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.10987e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4545  spore coat assembly protein SafA  37.5 
 
 
604 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3521  Peptidoglycan-binding LysM  41.3 
 
 
185 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.16778e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4559  spovid-dependent spore coat assembly factor safa; ftsk/spoiiie family protein; surface protein pspc  36 
 
 
613 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2843  peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 
187 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 
128 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  40.91 
 
 
547 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  45.65 
 
 
272 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4365  Peptidoglycan-binding LysM  43.18 
 
 
229 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  43.18 
 
 
620 aa  45.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4273  spore coat assembly protein SafA  37.5 
 
 
721 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.17 
 
 
470 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  37.78 
 
 
539 aa  45.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  28.26 
 
 
520 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  37.1 
 
 
285 aa  45.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.79 
 
 
389 aa  45.4  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0600559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  36.07 
 
 
304 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.38444e-05  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.45 
 
 
75 aa  44.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0920  spore coat assembly protein SafA  36 
 
 
538 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4324  lysM domain-containing protein  35.42 
 
 
587 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4172  spoVID-dependent spore coat assembly factor; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein  35.42 
 
 
621 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4161  spoVID-dependent spore coat assembly factor SafA; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein PspC  35.42 
 
 
609 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0893  Peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 
137 aa  44.7  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0690  SpoVID-dependent spore coat assembly factor SafA  35.42 
 
 
631 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.538953  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4507  spore coat assembly protein SafA  34 
 
 
615 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219196 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1207  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.23 
 
 
596 aa  44.3  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  42.86 
 
 
509 aa  44.3  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  21.51 
 
 
544 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  34 
 
 
448 aa  43.9  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  34.92 
 
 
293 aa  43.9  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  1.91073e-06 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  40.43 
 
 
428 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  39.53 
 
 
503 aa  43.5  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  44.44 
 
 
414 aa  43.5  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  32.76 
 
 
204 aa  43.5  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2954  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 
312 aa  43.5  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>