More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0043 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
654 aa  649  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 
648 aa  668  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  5.47947e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  59.72 
 
 
632 aa  794  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  5.21971e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 
657 aa  761  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  58.86 
 
 
645 aa  781  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 
660 aa  772  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  55.43 
 
 
650 aa  739  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  63.92 
 
 
516 aa  696  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  57.25 
 
 
645 aa  786  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.87272e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 
666 aa  657  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  63.6 
 
 
512 aa  706  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  5.89281e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  55.59 
 
 
660 aa  764  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
660 aa  765  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 
675 aa  667  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  60.52 
 
 
653 aa  822  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.7518e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 
653 aa  830  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  59.01 
 
 
645 aa  785  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  64.94 
 
 
648 aa  845  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
645 aa  641  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 
657 aa  761  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 
660 aa  776  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 
518 aa  689  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  8.85531e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 
651 aa  766  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  7.03201e-06 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 
647 aa  702  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.5899e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  61.81 
 
 
650 aa  827  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 
681 aa  689  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  56.67 
 
 
660 aa  770  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  62.17 
 
 
654 aa  827  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 
665 aa  681  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 
655 aa  1354  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 
656 aa  757  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
647 aa  644  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  55.59 
 
 
660 aa  764  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
660 aa  765  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  58.1 
 
 
659 aa  776  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 
660 aa  772  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  50.07 
 
 
702 aa  652  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
667 aa  652  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  56.84 
 
 
660 aa  771  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 
660 aa  766  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  61.41 
 
 
533 aa  687  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.02629e-05  hitchhiker  2.28434e-05 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 
664 aa  633  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
634 aa  627  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
675 aa  618  1e-175  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
629 aa  611  1e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
629 aa  611  1e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  4.13814e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
638 aa  603  1e-171  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 
651 aa  600  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
634 aa  599  1e-170  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 
510 aa  596  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 
509 aa  595  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.4425e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
650 aa  592  1e-168  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 
508 aa  590  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 
509 aa  589  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70708e-11 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 
671 aa  591  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 
511 aa  587  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 
509 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  5.97609e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 
509 aa  588  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 
506 aa  579  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
640 aa  572  1e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
636 aa  555  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 
644 aa  549  1e-155  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
642 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
648 aa  540  1e-152  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
628 aa  536  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
663 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
657 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
642 aa  531  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 
632 aa  528  1e-148  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  4.58098e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
638 aa  520  1e-146  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
624 aa  518  1e-145  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
670 aa  518  1e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
648 aa  511  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
629 aa  507  1e-142  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
530 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 
636 aa  494  1e-138  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
628 aa  492  1e-138  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
628 aa  491  1e-137  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0724  methionyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
670 aa  489  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
628 aa  490  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
538 aa  484  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
642 aa  485  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07450  methionyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
526 aa  481  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.988423 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 
516 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
526 aa  479  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 
519 aa  477  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
539 aa  478  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
516 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1802  methionyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 
516 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  46.98 
 
 
574 aa  473  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
530 aa  475  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  5.79293e-05 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2731  methionyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
541 aa  469  1e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.299776  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30340  methionyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
546 aa  468  1e-130  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20854  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2661  methionyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
529 aa  468  1e-130  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.539364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
530 aa  468  1e-130  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
722 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
530 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
512 aa  463  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 
511 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
628 aa  464  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>