More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0038 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
320 aa  658  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.58 
 
 
335 aa  172  7e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.44 
 
 
358 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  3.42072e-10 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  31 
 
 
329 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.13 
 
 
326 aa  162  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 
338 aa  162  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.75 
 
 
330 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.57 
 
 
322 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.53 
 
 
496 aa  148  1e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0741  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.08 
 
 
455 aa  144  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.31 
 
 
324 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  27.78 
 
 
568 aa  143  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.7 
 
 
529 aa  143  5e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.72 
 
 
589 aa  143  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.36 
 
 
550 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.63 
 
 
478 aa  141  1e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.07 
 
 
567 aa  141  2e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.63 
 
 
478 aa  141  2e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.98 
 
 
320 aa  139  5e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.90012e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.22 
 
 
517 aa  139  5e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.13 
 
 
332 aa  139  5e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.6 
 
 
737 aa  139  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.18 
 
 
344 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  2.88191e-06 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.32 
 
 
391 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.75 
 
 
335 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.28 
 
 
345 aa  137  3e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.96 
 
 
485 aa  137  3e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.33 
 
 
520 aa  137  3e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.58 
 
 
327 aa  135  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.29 
 
 
467 aa  135  9e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  30.8 
 
 
602 aa  135  1e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.96 
 
 
641 aa  134  2e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.3 
 
 
565 aa  134  2e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1793  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.26 
 
 
911 aa  134  2e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00315607  hitchhiker  3.97841e-07 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.3 
 
 
565 aa  134  2e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  36.67 
 
 
955 aa  134  2e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  9.46714e-07 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1448  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.18 
 
 
554 aa  133  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0128933  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.82 
 
 
501 aa  133  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.72 
 
 
588 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.5496e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 
586 aa  133  4e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2013  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  36.1 
 
 
1002 aa  132  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.3 
 
 
559 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  26.99 
 
 
321 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.00228e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.4 
 
 
613 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.04981e-05  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2302  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.16 
 
 
957 aa  132  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000141755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.26 
 
 
602 aa  132  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  34.59 
 
 
499 aa  132  7e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.54 
 
 
575 aa  132  8e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.3 
 
 
948 aa  131  1e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  4.66847e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.17 
 
 
323 aa  132  1e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  34.06 
 
 
326 aa  132  1e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1200  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.09 
 
 
667 aa  130  2e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.08 
 
 
343 aa  130  2e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.9 
 
 
1071 aa  131  2e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000102262  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.9 
 
 
1045 aa  130  2e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00214919  hitchhiker  0.000897105 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002885  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.06 
 
 
701 aa  130  2e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00493528  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.76 
 
 
663 aa  131  2e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  29.44 
 
 
548 aa  130  2e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03087  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.62 
 
 
736 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.6 
 
 
318 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.95 
 
 
644 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2615  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.97 
 
 
1137 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  4.43473e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.71 
 
 
320 aa  130  4e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54633e-15 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.78 
 
 
518 aa  130  4e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.44 
 
 
599 aa  130  4e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.97 
 
 
1115 aa  130  4e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000438447  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4439  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.38 
 
 
730 aa  129  5e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.56 
 
 
460 aa  129  5e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36 
 
 
939 aa  129  5e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  8.37393e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  33.81 
 
 
650 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.72 
 
 
562 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2690  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.36 
 
 
1137 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00745534  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2446  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.36 
 
 
1040 aa  129  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00022165  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.65 
 
 
331 aa  129  7e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0442  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.63 
 
 
546 aa  129  8e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.717493  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.06 
 
 
363 aa  129  8e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.95 
 
 
320 aa  129  8e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1454  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.77 
 
 
751 aa  129  9e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  3.25473e-05  normal  0.0490605 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.97 
 
 
527 aa  129  9e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  8.33689e-06 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.1 
 
 
914 aa  129  1e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  29.82 
 
 
562 aa  128  1e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  40.96 
 
 
320 aa  128  1e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2574  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.36 
 
 
1147 aa  128  1e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  5.34901e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.86 
 
 
921 aa  128  1e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.91992e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0275  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.52 
 
 
553 aa  128  2e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.01799  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02443  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.88 
 
 
698 aa  127  2e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  33.33 
 
 
605 aa  127  2e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.1 
 
 
383 aa  128  2e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.06 
 
 
363 aa  127  2e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.56 
 
 
562 aa  127  2e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0547  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.53 
 
 
643 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.014697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0507  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.53 
 
 
643 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000331221  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  29.82 
 
 
559 aa  127  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0561  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.53 
 
 
643 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.56 
 
 
562 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.53 
 
 
643 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  2.02258e-05  normal  0.0671233 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.82 
 
 
570 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.72 
 
 
562 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.72 
 
 
562 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.85 
 
 
589 aa  126  4e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  1.54817e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>