More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0033 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  100 
 
 
206 aa  421  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  48.28 
 
 
203 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  45.64 
 
 
210 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.55 
 
 
217 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.28 
 
 
219 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  43.3 
 
 
234 aa  167  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  44.61 
 
 
207 aa  166  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  7.22791e-05 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  42.93 
 
 
213 aa  166  3e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  43.87 
 
 
213 aa  164  6e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  42.03 
 
 
208 aa  162  2e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  42.03 
 
 
208 aa  162  2e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  42.03 
 
 
208 aa  162  2e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  42.03 
 
 
208 aa  162  2e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  42.03 
 
 
208 aa  162  2e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  43.52 
 
 
213 aa  162  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.33636e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  42.03 
 
 
208 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  41.26 
 
 
214 aa  162  4e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  42.03 
 
 
208 aa  162  4e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  40.1 
 
 
209 aa  162  5e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  39.9 
 
 
686 aa  161  5e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  41.18 
 
 
211 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  41.06 
 
 
208 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  41.06 
 
 
208 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  42.63 
 
 
688 aa  158  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  44.39 
 
 
214 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  40.8 
 
 
206 aa  157  8e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  40.1 
 
 
208 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  41.63 
 
 
208 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  42.11 
 
 
207 aa  156  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  39 
 
 
216 aa  155  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  39.81 
 
 
216 aa  155  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  38.92 
 
 
671 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  42.44 
 
 
219 aa  155  6e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  41.46 
 
 
210 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  41.44 
 
 
210 aa  153  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  41.06 
 
 
206 aa  153  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  42.65 
 
 
205 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  40.39 
 
 
212 aa  152  3e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  42.63 
 
 
901 aa  152  3e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  43.85 
 
 
295 aa  152  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  41.87 
 
 
221 aa  150  9e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  42.03 
 
 
214 aa  150  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  38.66 
 
 
207 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  39.81 
 
 
218 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  39.71 
 
 
236 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  37.04 
 
 
225 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  42.86 
 
 
213 aa  149  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  41.15 
 
 
233 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  7.2842e-09 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  41.26 
 
 
211 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  44.51 
 
 
204 aa  149  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  37.62 
 
 
686 aa  149  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  39.71 
 
 
226 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  38.46 
 
 
243 aa  149  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  39.81 
 
 
204 aa  148  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  40.48 
 
 
209 aa  149  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  40 
 
 
213 aa  148  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  38.92 
 
 
222 aa  147  1e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  41.46 
 
 
210 aa  147  1e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  42.31 
 
 
205 aa  147  1e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  43.59 
 
 
207 aa  147  1e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  37.26 
 
 
221 aa  146  2e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  41.75 
 
 
205 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  44.79 
 
 
206 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  38.16 
 
 
215 aa  145  4e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  44.79 
 
 
206 aa  145  4e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  39.34 
 
 
219 aa  145  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  39.52 
 
 
225 aa  145  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  38.92 
 
 
203 aa  144  7e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  39.51 
 
 
224 aa  144  8e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  37.32 
 
 
210 aa  144  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  39.25 
 
 
207 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  47.06 
 
 
197 aa  143  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  36.71 
 
 
213 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  40.78 
 
 
208 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  40.1 
 
 
210 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  38.81 
 
 
211 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  41.67 
 
 
200 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  40 
 
 
210 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  40.59 
 
 
214 aa  142  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  40.78 
 
 
205 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  40.1 
 
 
210 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  41.5 
 
 
199 aa  141  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  36.23 
 
 
217 aa  141  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  37.86 
 
 
213 aa  141  6e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  40.69 
 
 
213 aa  141  7e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  40.98 
 
 
203 aa  141  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  42.19 
 
 
205 aa  140  1e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  41.97 
 
 
199 aa  140  1e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  42 
 
 
197 aa  140  1e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  37.98 
 
 
212 aa  140  1e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  39.23 
 
 
218 aa  140  1e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  39.42 
 
 
217 aa  140  1e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  36.82 
 
 
707 aa  140  1e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  40.49 
 
 
207 aa  140  1e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  40.39 
 
 
206 aa  139  2e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  41.67 
 
 
206 aa  140  2e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  39.42 
 
 
244 aa  140  2e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  40.2 
 
 
202 aa  140  2e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  47.06 
 
 
197 aa  140  2e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  40.89 
 
 
206 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>