148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0026 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
435 aa  886  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  28.76 
 
 
421 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  28.76 
 
 
421 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  27.11 
 
 
404 aa  83.2  9e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  26.74 
 
 
404 aa  78.6  2e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  26.45 
 
 
404 aa  71.6  2e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  27.17 
 
 
403 aa  70.9  4e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  27.17 
 
 
403 aa  70.9  5e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  26.81 
 
 
403 aa  69.3  1e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  26.81 
 
 
403 aa  69.3  1e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  26.81 
 
 
403 aa  69.7  1e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 
288 aa  68.2  3e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  26.35 
 
 
403 aa  67.8  4e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  26.71 
 
 
403 aa  66.6  9e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  25.38 
 
 
294 aa  59.7  9e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  25.38 
 
 
294 aa  59.7  1e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  25.38 
 
 
294 aa  59.3  1e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  25.38 
 
 
294 aa  59.3  1e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  25.38 
 
 
294 aa  59.7  1e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1434  helix-turn-helix domain-containing protein  25.6 
 
 
433 aa  58.5  2e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.673914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  25.38 
 
 
294 aa  57.8  3e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.13559e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  25.39 
 
 
285 aa  57.4  5e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  23.9 
 
 
285 aa  57.4  5e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0510  transcriptional activator (transcriptional regulator)  23.4 
 
 
423 aa  57  6e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.924451  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1013  transcriptional regulator, XRE family  23.79 
 
 
297 aa  57  7e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  25.2 
 
 
285 aa  57  7e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.66 
 
 
636 aa  55.8  1e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0508  transcriptional activator (transcriptional regulator)  23.4 
 
 
423 aa  56.2  1e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 
292 aa  55.1  3e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1433  hypothetical protein  26.88 
 
 
421 aa  54.7  4e-06  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.38 
 
 
1279 aa  54.3  4e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4288  transcriptional regulator, XRE family  24.29 
 
 
297 aa  53.9  5e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.492783  normal  0.641627 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 
436 aa  53.9  6e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2224  helix-turn-helix domain protein  30.84 
 
 
403 aa  53.1  9e-06  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.163485  hitchhiker  0.00213028 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  24.55 
 
 
285 aa  52.8  1e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  24.09 
 
 
285 aa  52.8  1e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  24.09 
 
 
285 aa  52.8  1e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  41.43 
 
 
181 aa  52  2e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 
487 aa  52.4  2e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  41.43 
 
 
181 aa  52  2e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  41.43 
 
 
181 aa  52  2e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  41.43 
 
 
181 aa  52  2e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
181 aa  52  2e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.4317e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
181 aa  52  2e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  41.43 
 
 
181 aa  51.6  3e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  24.3 
 
 
292 aa  51.6  3e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  41.43 
 
 
181 aa  51.6  3e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 
105 aa  50.8  4e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0425  transcriptional regulator  22.98 
 
 
297 aa  50.8  5e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.732449  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1699  hypothetical protein  35.09 
 
 
421 aa  50.8  5e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000791794  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 
242 aa  50.4  6e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.36736e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  40 
 
 
181 aa  50.1  8e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  24.09 
 
 
285 aa  49.7  9e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 
184 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  33.66 
 
 
184 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  3.74058e-09 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3325  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 
132 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951431  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0668  transcriptional regulator, XRE family  21.9 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0665  transcriptional regulator  23.49 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  25.19 
 
 
287 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
128 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1019  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 
107 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  24.91 
 
 
301 aa  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
178 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 
1261 aa  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 
181 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0566  transcriptional regulator  21.93 
 
 
422 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  42.42 
 
 
188 aa  47.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  3.53927e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.2 
 
 
1154 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0597  transcriptional regulator  21.93 
 
 
422 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  36.51 
 
 
213 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  44.44 
 
 
175 aa  47.4  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  34.48 
 
 
430 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06770  predicted transcriptional regulator  36.25 
 
 
106 aa  47  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5721  hypothetical protein  29.9 
 
 
431 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380907  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
178 aa  47.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 
182 aa  47  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  26.9 
 
 
1288 aa  47  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0523  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 
631 aa  46.6  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0179552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0514  helix-turn-helix domain-containing protein  34.21 
 
 
426 aa  46.6  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3280  peptidase M48 Ste24p  23.42 
 
 
452 aa  46.6  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227869  normal  0.68858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
198 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  25.12 
 
 
421 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  22.4 
 
 
650 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0423  transcriptional regulator/TPR domain protein, putative  21.15 
 
 
427 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1805  putative regulator protein  23.58 
 
 
708 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569489 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1934  DNA-binding protein  43.33 
 
 
179 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  43.33 
 
 
179 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0198  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
109 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2835  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 
287 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356723  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 
176 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  1.44131e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  24.8 
 
 
1056 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3149  putative transcription regulator protein  35.94 
 
 
113 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.369647 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0979  GGDEF family protein  24.5 
 
 
667 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  31.53 
 
 
179 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.01746e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  30.1 
 
 
252 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 
1054 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
179 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18183e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3225  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 
93 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  23.93 
 
 
1252 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>